MALBAC技術

MALBAC技術(multiple annealing and looping-based amplification cycles),即多次退火環狀循環擴增技術,是"目前最先進的全基因組擴增技術"。該技術於2012年12月刊登於《科學》雜誌上(Science

基本介紹

  • 中文名:多次退火環狀循環擴增技術
  • 外文名:multiple annealing and looping-based amplification cycles
  • 又稱:MALBAC技術
  • 實質:全基因組擴增技術
  • 刊登時間:2012年12月
  • 發布地方:《科學》雜誌
技術簡介,技術特點,技術優勢,

技術簡介

不同於以往的非線性或指數型擴增方法,MALBAC技術利用特殊引物,使得擴增子的結尾互補而成環,從而很大程度上防止了DNA的指數性擴增。

技術特點

1. 起始模板量由微克級(μg)降低到皮克級(pg)。
2. 擴增均勻性遠遠好於其他擴增技術。
MALBAC技術
細胞拷貝數CNV分析。結果分析:分析與標準樣品高度一致。
MALBAC技術
3. 90%以上位點可被成功擴增。

技術優勢

可適用樣品類型
  1. 樣本少,常規分析無法進行基因組或轉錄組分析。
2. 樣本高度異質,細胞間存在重大差異。
MALBAC技術和其它WGA技術相比較
WGA技術
主要原理
優點
缺點
套用
多次退火環狀循環擴增技術
操作簡單,產量高,最低起始模板幾個皮克,結果可靠可重複
起始模板量極低時擴增難度加大
二代測序、CGH、SNP分型、STR分型、基因克隆、螢光定量
部分隨機引物法
操作簡單,最低起始模板量達50pg,產物片段大小0.5-10kb
起始模板量低時擴增偏差大
CGH, SSCP分析,SNP分型,STR分型
LM-PCR
連線介導的
PCR反應
產量高,片段長,對模板DNA質和量要求低
操作繁瑣,多步操作易丟失模板
DNA
CGH,LOH研究,STR分型
PEP-PCR
完全隨機引物法
對模板DNA質和量要求低,操作簡單,易改進,50 ng起始模板可產生0.2-0.5μg產物,最低起始模板量可達5 pg。
產量低,保真性差
LOH研究,SNP分型,STR分型
MDA
多重置換擴增
產量高,50 ng起始模板量可產生10-20μg產物,最低起始模板量可達10 pg,忠實性好。
起始模板量低時擴增偏差大
CGH,RFLP分析,SNP分型,STR分型
pWGA
體外再造T7噬菌體DNA複製
產量高,對模板質和量要求低,操作簡單,最低起始模板量可達100 fg
保真性稍差
SNP分型,STR分型

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