eDNA

eDNA是指在環境樣品中所有被發現的不同生物的基因組DNA的混合。

2018年4月12日，美國華盛頓州立大學助理教授Caren Goldberg通過檢測環境DNA（eDNA），確證了全球第四隻斑鱉的存在。

基本介紹

• 中文名：環境DNA
• 外文名：eDNA
• 存在：土壤、沉積物、排泄物
• 特點：基因組DNA的混合

定義

eDNA的環境樣品是一個非常寬鬆的概念，可以包括土壤、沉積物、排泄物、空氣、水體，甚至生物個體本身（如馬氏網捕獲的昆蟲）。動物在某個環境中生活，身上的各種痕跡會攜帶著自身DNA掉落到四周。

作用

作為一項技術，分析eDNA的目的就是獲取這些環境樣品中DNA所屬物種的分類學信息和基因功能信息。再講通俗一點，科學家提取環境樣品中的eDNA，就是為了分析這些DNA分別是屬於哪些物種，從而證實在相應環境中存在哪些物種。eDNA的目的，與傳統的動植物分類調查其實是一致的。

類型

第一類eDNA類似於對環境的生物多樣性調查，方法是檢測環境樣品中儘可能多的DNA序列，與資料庫比對分析它們所屬的物種分類信息，最終鑑定在這個環境中生活的所有物種，這個方法又被稱為DNA宏條形碼（DNA metabarcoding）。在樣品處理上，DNA宏條形碼使用普通的聚合酶鏈式反應（PCR）或直接霰彈槍法（shotgun strategy）測序，這兩個實驗方法都比較成熟，能夠方便獲得多個DNA序列。

另一類eDNA技術類似於特定生物調查，目標是尋找在環境樣本中是否有單一物種的DNA存在，通常用於研究和追蹤珍稀物種在自然界的分布。它與第一類DNA宏條形碼的區別在於它並不在意環境中屬於其它物種的DNA，因此在樣品處理上通常使用更精確的定量PCR（qPCR）技術，目標是找到極其少量的目標物種的DNA。

套用

2018年4月12日，全球最權威的龜鱉保育組織TSA（國際龜鱉生存聯盟，Turtle Survival Alliance ）在官網上宣布確認全球第四隻斑鱉的存在。美國華盛頓州立大學助理教授Caren Goldberg通過檢測環境DNA（eDNA），確證了該斑鱉的存在。

斑鱉