在新劇場版破當中再次登場,較於原TV版外形有較大改造,最明顯處無疑為頭部的外形改變.同時在新劇場版中加入了新的功能→THE BEAST(使EVA擺脫人形的限制,獸化,發揮出超常的能力).但因為面對的是最強的拒絕型使徒,幾番交戰後,還是受到極大損傷,而後在零號機想要突破使徒力場時,協助咬破了使徒的最後幾層力場。在劇場版第三部Q中二號機被修復,並重新交由明日香駕駛.。但是二號機的修復並不完全,比如右眼,左臂等處,可能因為是Wille的科技水平不足以完全修復,在真希波的8號機的援助成功奪回了初號機後,又在水下幫助啟動了Wille的特殊戰艦Wunder,在決戰阻止13號機時耗盡了電源,幸虧8號機及時把後備電池扔了過來得以繼續行動。而後Wunder在壓制覺醒狀態的十三號機時遭到了使徒化的9號機的侵蝕,Wunder的控制權險些被Mark.09奪取,明日香讓真希波去阻止13號機,自己啟動了暗號777(Triple 7),不同於破中的The Beast,這次拘束栓完全脫離2號機,獸化的2號機用嘴接住了炮,保護了Wunder,並將九號機零距離射穿,但九號機全身都由核心組成得以復原,由於時間已經到達極限,明日香迫不得已說:“對不起了,2號機”啟動了自爆裝置和插入栓彈出裝置,2號機隨即與9號機同歸於盡,在結尾處Wunder的甲板上出現了2號機和8號機的殘骸,有趣的是Q片尾下集預告中有一部奇怪的EVA,像是8號機和2號機的合體,解說中這部EVA的名字是 EVA 8 plus 2號機。