DNA甲基化免疫共沉澱技術(MeDIP or mDIP) ，是一個大範圍的染色體或基因組純化技術，在分子生物學中被用於富集DNA甲基化序列。
基本介紹
- 中文名：DNA甲基化免疫共沉澱技術
- 外文名：Methylated DNA immunoprecipitation
- 所屬學科：生物學
- 作用：用於富集DNA甲基化序列
概念,背景,局限性,
概念
DNA甲基化免疫共沉澱技術(MeDIP or mDIP) ，是一個大範圍的染色體或基因組純化技術，在分子生物學中被用於富集DNA甲基化序列。
MeDIP流程最先由Weber M. et al提出。這項技術為DNA甲基化水平的測定鋪平了道路，因為這項技術使DNA甲基化淨化率可以輸入高通量DNA檢測儀中，例如高解析度微陣列（medip-chip）或下一代測序技術（medip-seq）。然而，目前對甲基化組的理解仍然很有限。像其他表觀遺傳學現象一樣，甲基化水平的研究受到不同細胞型需要不同研究模式而使研究工作變得非常複雜。
背景
DNA甲基化對生命活動非常重要，是基因調控的手段之一（即，通過對位於啟動子及第一外顯子區的CpG島的甲基化而抑制基因的表達），它在維持細胞正常功能、傳遞基因組印記，胚胎髮育、腫瘤發生等方面起著至關重要的作用，更是表觀遺傳學研究的熱點。
對於DNA甲基化的檢測，目前採用：甲基化DNA富集並結合高通量測序（MBD-Seq, Methylated DNABinding Domain-Sequencing）的方法。MBD-Seq的原理是：由於在哺乳動物中甲基化一般發生在CpG的胞嘧啶5位碳原子上，所以可通過特異性結合甲基化DNA的蛋白MBD2b或5’-甲基胞嘧啶抗體富集高甲基化的DNA片段，並結合第二代高通量測序，對富集到的DNA片段進行測序，從而檢測全基因組範圍內的甲基化位點。
局限性
MeDIP套用過程中需要注意的是實驗中的經典注意事項。包括質量和交叉反應的5mc抗體使用過程。此外，DNA檢測技術（陣列雜交和高通量測序）都會涉及常見的局限性。最典型的限制是，需要使用高通量測序。
