CRJ900飛機於1999年10月對外公布研製方案，2000年第二季度確定了合作夥伴和零部件供應商。CRJ900是CRJ700的加長型，與CRJ100/200/700一起構成CRJ系列，覆蓋50～90座級的支線客運航線。CRJ系列在大飛機難以盈利的航線上具有極其獨特的優越性，它不僅可以用於擴大點對點的支線運輸，還可以用於增加從樞紐機場的輻射式運輸，同時還能使航空公司改善乘客服務並提高效益。
CRJ900原型機是由CRJ700的原型機C-FRJX改裝而成，加長了機身，保留了CRJ700的機翼、發動機和起落架，2001年2月21日進行了首飛。首架生產型飛機於2001年第一季度開始組裝，2001年10月20日完成首飛。2002年9月9日獲得加拿大運輸部適航證，同年10月25日獲得美國聯邦航空局適航證，12月23日獲得歐洲航空安全局適航證。首架飛機於2003年2月3日交付美國梅薩航空公司，並於同年4月26日投入使用。
CRJ900項目的研製成本為2億加元，單機價格為3000萬加元(按2002年幣值計算)。龐巴迪宇航集團預計未來20年CRJ900系列飛機市場約為800架。截至2008年7月31日，CRJ900飛機共獲訂單250架，交付172架。
CRJ900飛機主要型別有：CRJ900基本型以及在基本型基礎上發展的CRJ900ER延程型和CRJ900LR遠程型，目前最新的型號為CRJ900NG型。
