雲南省體育局財務管理和審計中心於2002年4月經雲南省機構編制委員會批准成立，屬正處級全額撥款事業單位，核定事業編制10人，其中處級領導職數2人（1正1副）；編制結構為：管理人員編制4人，專業技術人員編制6人。
雲南省體育局財務管理和審計中心在雲南省體育局黨組領導下，在雲南省體育局計畫財務處和監察室的指導下開展工作。主要負責雲南省體育局部分直屬單位財務集中管理和所屬單位財務工作的指導、監督；對雲南省體育局各直屬單位財務有計畫的專項審計及領導幹部離任審計、直屬單位基本建設項目預決算審計、重大投資項目和重要物質採購進行內部審計等工作。自2013年起，逐步對雲南省體育局部分直屬事業單位及雲南省級體育單項協會實施財務集中管理，通過統一管理制度，強化財務基礎工作，規範會計核算行為，完善財務監督機制，建立公開、高效、規範、務實的資金管理運行機制。
