陝西省立醫學專科學校籌建於1938年4月，當年9月開始招生開學；1949年8月併入西北大學醫學院，歷時11年余。校長第一任由留日歸國學者薛健擔任，由籌建起至1940年8月，再由留德學者李賦京繼任至1942年10月，第三任由留日學者張善鈞至1944年11月，第四任由留德學者張迺華至1949年8月。
學校最初設於西安西華門陝西省立醫院（陝西省中醫藥研究院現址）對面的陝西省立助產學校。因日機轟炸西安，1938年12月遷往南鄭聯立中學上課，1939年7月因聯立中學索還校址，一度借女子師範學校教室上課。1939年9月因日寇集中轟炸漢中而再回西安，因原校址被省糧食局占用，遂借用東關龍渠堡私立民立中學（西安市二中現址）校舍上課。
李賦京教授任校長後，增聘教師，充實了教學力量，制訂了教室規則、寢室規則、食堂規則、接待室規則、請假規則、學生張貼告白辦法、學生獎懲規則等9個訓導章程，對學校發展起到重要作用。1943年3月學校又遷至城隍廟后街原省立第一中學（今西安市25中學址）舊址，直至1949年並校。
陝西醫專學制起始為5年（上課4年，實習1年），招收高中畢業生；1942年應戰時需要縮短為4年；1946年恢復5年制；學校每年招收一班，共畢業8班學生288人；1949年8月併入西北大學醫學院後當年未招新生，在校三班學生改為6年制。
陝西省立醫專創建於西安，從淪陷區遷來的衛生科技界人士多匯集於此，教師聘任較齊全，南遷漢中時有所流失。抗戰期間和抗戰勝利後，在漢中和西安，曾兩次與西北聯大醫學院和西北大學醫學院教師互兼課程，也吸收在陝的河南大學醫學院教師授課。李賦京、張金波、張效宗、孫國禎、張保真、侯又可、王振中、陳東震、白書元、徐佐夏、毛鴻志等先後擔任基礎授課，王季陶、王耕、劉蔚同、李蔚潭、尤仙航、張善鈞、劉鳳崗、吳霽棠、劉輔仁、張迺華、隋式棠等擔任臨床授課，從西北醫學院轉來的婦產科教授王同觀曾任教務長。
陝西醫專在授課期間，教材有少數用石印講義散發學生，一般是靠教員口授和在黑板上書寫，學生予以筆記。學校有屍體一具、顯微鏡兩架（1946年又增添三架），1946年有圖書約480冊，掛圖約240張，教學儀器約182件。曾設病理學、生理學和解剖學三個“學館”（即教研室）。1943年至1945年三屆畢業生應戰時需要，均應徵調，由軍政部軍醫署和民政部衛生署分派戰時工作，徵調額為50%。張迺華教授主政期間，曾制訂 “愛惜光陰，恪守時間” 校訓，以書匾懸於校內。
1949年5月西安解放後，省立醫專和西北大學醫學院各有兩隊學生隨中國人民解放軍參加解放大西北戰役。
