錘頭型核酶

大多數具有自我剪下能力的RNA形成錘頭型結構（hammerhead structure），這類RNA常被稱為錘頭型核酶。

一種序列特異的核糖核酸酶，從一種RNA病毒中分離得到，其複製依賴自我剪下。

病毒複製時，連續的RNA鏈上產生多個拷貝，單個類病毒的形成有賴於周圍RNA的剪下。這種具有自我剪下作用的RNA由於其二級結構類似於錘頭，其錘頭結構有三個配對的柄組成，包圍著起催化作用不互補的核苷酸中心，三級結構近似於Y型。

錘頭型結構為該類酶的二級結構，該二級結構由三個莖（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ）構成，莖區是由互補鹼基構成的局部雙鏈結構，包圍著一個由11~13個保守核苷酸構成的催化中心。核酶剪下通常發生在H（H是除G以外任意的核苷酸）位點。同一核酶分子由具有催化中心的核酶和含有剪下位點的底物部分共同組成錘頭結構，底物部分是切割部位兩端的核苷酸，它與核酶的莖Ⅰ和莖Ⅲ結合，在切割之後，該底物被釋放，由一個新的沒有被切割的底物取代，使切割反應得以重複進行。