遞減聚合酶鏈式反應

遞減PCR,亦稱降落PCR(touchdown PCR)是一種PCR(聚合酶鏈式反應)方法,用來避免非特異性序列的擴增。PCR中引物的黏合溫度(annealing temperature)決定了黏合的特異性,溫度越高特異性越強,但過高則不能實現引物和模板的結合,而過低會產生大量非特異性產物。因此進行PCR時需要尋找合適的黏合溫度。

基本介紹

  • 中文名:遞減聚合酶鏈式反應
  • 外文名:touchdown PCR
簡介,聚合酶鏈式反應,簡併引物,

簡介

遞減PCR,亦稱降落PCR(touchdown PCR)是一種PCR(聚合酶鏈式反應)方法,用來避免非特異性序列的擴增。PCR中引物的黏合溫度(annealing temperature)決定了黏合的特異性,溫度越高特異性越強,但過高則不能實現引物和模板的結合,而過低會產生大量非特異性產物。因此進行PCR時需要尋找合適的黏合溫度。
遞減PCR開始先設定一個比較高的黏合溫度,每個循環黏合溫度下降1℃,到一個較低溫度以後每個循環的黏合溫度保持不變直到結束。在剛下降到特異性結合可以進行的最高溫度時,可以達到最高的特異性。這樣在起初的幾個循環中,特異性擴增序列可以相對非特異性序列多擴增若干倍,從而減輕非特異性擴增對結果的干擾。這種方法可用於省去多次試驗最佳黏合溫度的工作。
此外,遞減PCR還可與簡併引物(degenerate primer)結合使用,用來推出一段已知肽鏈胺基酸序列所對應的DNA鹼基序列。

聚合酶鏈式反應

聚合酶鏈式反應英文Polymerase chain reaction縮寫PCR),是一種分子生物學技術,用於擴增特定的DNA片段,這種方法可在生物體外進行,不必依賴大腸桿菌酵母菌等生物體。這種方法由凱利·穆利斯(Kary Mullis)於1983年開發,當時他是Cetus公司的雇員,也是1993年諾貝爾化學獎的獲得者,它是一種簡單,廉價和可靠的方法複製DNA片段,這個概念適用於現代生物學和相關科學的許多領域。 PCR可能是分子生物學中使用最廣泛的技術。這種技術被用於生物醫學研究,犯罪取證和分子考古學。
微生物複製是一個費時耗力的流程,首先要將DNA經限制酶剪裁,再利用連線酶(Ligase)加到載體(Vector)中,之後利用瞬間電擊(Electroporation)或是熱休克(Heat Shock)的方式,送到大腸桿菌感受態細胞(competent cell)中,將此菌於培養皿大量繁殖培養,再經過繁複的分離、純化過程,時間通常需要近一周,才能大量複製片段。所以僅需一小時的PCR能節省大量時間和繁複的操作,聚合酶鏈式反應技術被廣泛地運用在醫學生物學的實驗室,例如用於判斷檢體中是否會表現某遺傳疾病的圖譜、傳染病的診斷、基因複製,以及親子鑑定

簡併引物

用於聚合酶鏈式反應的特殊引子,含有化學合成的特殊鹼基,能和多種鹼基配對。用於讓引子順利配對到鹼基稍有不同的DNA。 例如ATCGC*CTGG引子*表示能與TC結合的特殊鹼基。能和TAGCGAGACC,TAGCGGGACC這兩種稍有不同的DNA完全配對。

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