莆田市生態環境局是莆田市機構改革組建的新部門。
工作職責,現任領導,
工作職責
莆田市生態環境局將市環境保護局的職責，以及市發展和改革委員會的應對氣候變化和減排職責，市國土資源局的監督防止地下水污染職責，市水利局的編制水功能區劃、排污口設定管理和流域水環境保護職責，市農業局的監督指導農業面源污染治理職責，市海洋與漁業局的海洋環境和漁業水域生態保護職責等整合，組建市生態環境局，作為市政府工作部門，正處級。
縣級生態環境部門對應市生態環境局相應劃轉職責，作為市生態環境局的派出機構。
不再保留市環境保護局及各縣區的環境保護局。
現任領導
局長：朱正揚
副局長：錢奕新、張平生、林荔煌、陳國水
