石濤，中國科學院武漢植物園研究員，主要從事植物基因組進化、表觀組學、基因調控網路、群體基因組學的研究。2007年本科畢業於華中農業大學，2012年博士畢業於中國科學院大學/武漢植物園，2022年12月起任研究員。
研究方向聚焦被子植物早期分化類群基因組演化，主持湖北省青年拔尖人才培養計畫（2024-2026）及國家自然科學基金面上項目（2022-2025）等課題。創建《Genes》期刊特刊，開發群體基因組分析方法ST4gCNV並套用於蓮屬植物研究。以通訊作者在《Nature Plants》《Plant Cell》等期刊發表論文，涉及睡蓮目基因組演化及植物基因組劑量效應研究。入選中國科學院青年創新促進會（2019）和湖北省青年拔尖人才（2024）。
基本介紹
- 中文名：石濤
- 畢業院校：中國科學院大學
人物經歷,研究方向,代表論著,所獲榮譽,
人物經歷
2003.9-2007.6 華中農業大學 本科。
2004.9-2007.6 華中科技大學 英語雙學位。
2007.9-2012.6 中國科學院大學/中國科學院武漢植物園 植物學專業，博士研究生。
2013.9-2015.10 蘭州大學 博士後。
2015.11-2018.8 中國科學院武漢植物園 助理研究員。
2018.9-2022.11 中國科學院武漢植物園 副研究員。
2022.12- 中國科學院武漢植物園研究員。
研究方向
植物基因組進化，表觀組學，基因調控網路，群體基因組學。
代表論著
- Tao Shi, Cécile Huneau, Yue Zhang, Yan Li, Jinming Chen, JérÔme Salse, Qingfeng Wang (2022). The slow-evolving Acorus tatarinowii genome sheds light on ancestral monocot evolution. Nature Plants, 8: 764-777.
- Tao Shi, Jinming Chen (2020). A reappraisal of the phylogenetic placement of the Aquilegia whole-genome duplication. Genome Biology, 21: 295.
- Tao Shi, Razgar Seyed Rahmani, Paul F Gugger, Muhua Wang, Hui Li, Yue Zhang, Zhizhong Li, Qingfeng Wang*, Yves Van de Peer, Kathleen Marchal, Jinming Chen (2020). Distinct expression and methylation patterns for genes with different fates following a single whole-genome duplication in flowering plants. Molecular Biology and Evolution, 37(8): 2394-2413.
- Zhiyan Gao, Xingyu Yang, Jinming Chen, Mark D Rausher, Tao Shi (2022) Expression inheritance and constraints on cis- and trans-regulatory mutations underlying lotus color variation, Plant Physiology, DOI: 10.1093/plphys/kiac522
- Yue Zhang, Xingyu Yang, Yves Van de Peer, Jinming Chen, Kathleen Marchal, Tao Shi (2022). Evolution of isoform-level gene expression patterns across tissues during lotus species divergence. The Plant Journal, 112(3): 830-846.
- Hui Li, Xingyu Yang, Qingfeng Wang, Jinming Chen, Tao Shi (2021). Distinct methylome patterns contribute to ecotypic differentiation in the growth of the storage organ of a flowering plant (sacred lotus). Molecular Ecology, 30:2831–2845.
- Hui Li, Xingyu Yang, Yue Zhang, Zhiyan Gao, Yuting Liang, Jinming Chen, Tao Shi (2021). Nelumbo genome database, an integrative resource for gene expression and variants of Nelumbo nucifera. Scientific Data, 8: 38.
- Tao Shi, Kun Wang, Pingfang Yang (2017) The evolution of plant microRNAs-insights from a basal eudicot sacred lotus. The Plant Journal, 89(3): 442-457.
- Tao Shi(2016) Impact of gene family evolutionary histories on phylogenetic species tree inference by gene tree parsimony. Molecular Phylogenetics and Evolution, 96: 9-16.
所獲榮譽
2010中科院武漢分院“昌華獎學金優秀獎”
2014全國植物生物學大會牆報優秀獎
2016第三十界全國荷花展優秀論文獎
2017中國科學院武漢植物園明星員工
2019中國科學院青年創新促進會會員
2020中國科學院武漢植物園明星員工
