在男科檢查中，詢問病史是男科疾病診斷的首要環節和最基本的檢查步驟，以此可大致確定體檢的範圍，必要時再做實驗室檢查和選擇性的特殊檢查。
注意事項,
檢查項目
(一)病史採集
詢問病史是男科疾病診斷的首要環節和最基本的檢查步驟。
1.既往史
儘可能詳細的了解既往疾病、損傷及手術史。
2.個人史
職業上有無毒物、放射線接觸及高溫作業史；有無長期服藥史包括癌症化療藥物、激素類藥物；有無接受損傷劑量射線輻射及接觸有害化學製劑、尼古丁慢性中毒等。
3.婚姻及性生活史
結婚年齡、生育情況、是否避孕、採用何種避孕措施；配偶年齡、職業及生育史；性生活史。
4.家族史
父母、兄弟姐妹的健康及生育情況，有無遺傳性疾病及可能與遺傳有關的疾病，患遺傳性疾病者多表現有少精子症或無精子症。
5.生殖、泌尿系疾病史
有無炎性或梗阻性尿路症狀。
(二)體格檢查
體格檢查包括全身檢查和生殖器官檢查兩部分。
1.全身檢查
測量身高、身高與臂長比例、體重。注意體態、體毛分布、視野、嗅覺、甲狀腺、喉結、男性乳房發育，以及血壓和心肺等情況。
2.生殖器官檢查
觀察陰毛分布；包皮有無過長或包莖，陰莖頭有無紅腫、糜爛，尿道有無排尿困難、瘺孔、下裂、尿道口有無分泌物、狹窄及異位，陰莖海綿體有無腫塊、硬結，陰莖長度，能否勃起、勃起硬度；有無陰囊畸形、發育不良，有無水腫、潰瘍、竇道、壞死及腫瘤；睪丸、附睪的位置、大小、軟硬度，有無腫脹、觸痛、粘連或結節性硬塊、是否為隱睪；精索、輸精管有無增粗、結節或觸痛、有無精索靜脈曲張；腹股溝有無潰瘍、瘢痕及腫大淋巴結；直腸指診前列腺和精囊，注意前列腺大小、質地硬度、有無觸痛和壓痛，表面光滑否、可否捫及結節雙側葉是否對稱、中央溝是否存在。
(三)實驗室檢查和其他輔助檢查
實驗室檢查包括一般實驗室檢查、精液檢查、內分泌功能檢查、細胞遺傳學檢查、生殖道分泌物細菌學檢查、活組織檢查等。特殊檢查中常用的是X線檢查、超聲診斷檢查（必要時可行經直腸超聲檢查）、放射性核素檢查、紅外熱像圖檢查等。
1.血常規檢查
紅細胞、白細胞、血紅蛋白及血小板計數。
2.尿常規檢查
尿常規異常多數是腎臟或尿路疾病的第一指征。尿常規白細胞出現大量＋，提示提示泌尿系感染、或結石、結核等；尿常規中出現紅細胞，並超過3個＋，提示泌尿系炎症、結石、腫瘤、腎炎等；尿蛋白異常是腎炎、腎病綜合徵的標誌。
3.前列腺液檢查
前列腺液(EPS)檢查主要用於明確前列腺炎的診斷，其方法有直接塗片、細菌培養、脫落細胞及免疫學檢查。
4.精液常規和生化檢查
精液分析可反映睪丸精子發生及附性腺功能狀況。
5.分泌功能檢查
男性生殖內分泌活動受下丘腦一垂體一睪丸生殖軸系的調控，測定血清中生殖激素水平對判斷性腺軸功能狀態和臨床診斷的定位定性有重要價值。
6.睪丸活檢
睪丸活檢不僅可評價睪丸生精功能及生精障礙程度、鑑別不育病因、診斷睪丸癢病、判斷預後，而且睪丸活檢的超微結構特點還被用於評價男子抗生育效果及抗生育機制研究。
7.超聲診斷檢查
超聲檢查能實時顯示男性生殖器官的斷層圖像，診斷組織增生、結石、囊腫、炎症和腫瘤，以及探查生殖系組織的損傷、出血等。
8.影像學檢查
男性生殖系放射線影像可觀察男性生殖系本身病變以及繼發於周圍臟器病變的變化。CT檢查主要是檢查前列腺、睪丸腫瘤等。
9.尿流率測定
對疑似患有下尿路功能障礙，輔助檢測患者排尿的功能有無異常。
注意事項
1.檢查前一天晚上洗澡、換潔淨的內衣。
2.男性精液檢查：留精液前，患者應停止性交4-7天。檢查前1周不能用丙酸睪丸酮、苯乙酸睪丸酮、苯丙酸諾龍。檢查前1個月內應停止飲酒。不要將精液暴露在過熱和過冷的環境中。及時交給醫生備查，不得超過30分鐘。
3.檢查時不必緊張和害羞，不要憋尿。
