王壽文(清華大學物理學博士,西湖大學博士生導師)

王壽文(清華大學物理學博士,西湖大學博士生導師)

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王壽文,2009-2013年獲清華大學工程物理系本科學位,並輔修計算機專業。2013-2018年在清華大學獲得物理學博士學位. 期間,他從非平衡態統計物理的角度,研究了從信號轉導到集群共振等生物系統,進一步闡明了生命系統中能量與功能的關係。2018-2022年在哈佛大學醫學院系統生物學系進行博士後研究工作,主要開發單細胞譜系追蹤數據的分析方法,並結合轉錄組與表觀遺傳組,進一步理解細胞分化與胚胎髮育的基本規律。博士後期間獲得了Damon Runyon癌症研究基金會的資助。2023年起,任西湖大學生命科學學院研究員、博士生導師,任西湖大學理學院物理系兼聘教授。

基本介紹

  • 中文名:王壽文
  • 國籍:中國
  • 畢業院校:清華大學
  • 職稱:教授
研究方向與成果,代表論文,

研究方向與成果

王壽文博士開發了一系列的計算方法,包括:在單細胞層面結合轉錄組與譜系信息,有效預測早期幹細胞的命運選擇;開發單細胞多組學數據分析方法,並與譜系信息結合,揭示細胞命運選擇與身份維持的分子基礎。
其實驗室致力於開發用於單細胞譜係數據的定量分析和建模方法,並結合轉錄組和表觀遺傳學測量,進一步揭示細胞分化和組織穩態等不同尺度的生物學問題背後的分子機制。實驗室將與其他課題組密切合作,整合前沿的譜系追蹤實驗設計和數據採集,並從統計物理、計算機科學和套用數學等不同領域中汲取數據分析靈感,走一條學術交叉、計算實驗結合的科研之路。

代表論文

* These are corresponding authors.
1, L. Li, S. Bowling, Q. Yu, Karel Alcedo, Wei-Chien Yuan, Mark Ferreira, A. M. Klein, S.-W. Wang*, F. D. Camargo*, DARLIN mouse enables efficient joint profiling of lineage barcodes, transcriptome, and epigenome in single cells (2022, in preparation).
2, S.-W. Wang*, M. J. Herriges, K. Hurley, D. N. Kotton, A. M. Klein*, CoSpar identifies early cell fate biases from single cell transcriptomic and lineage information, Nat. Biotechnol. (2022).
3, A. E. Rodriguez-Fraticelli, C. S. Weinreb, S.-W. Wang, R. P. Migueles, M. Jankovic, M. Usart, A. M. Klein, S. Lowell, F. D. Camargo*, Combined single cell lineage and transcriptome sequencing reveals Tcf15 as a master regulator of hematopoietic stem cell fate, Nature 583, 585 (2020).
4, S.-W. Wang*, and L.-H. Tang*, Emergence of collective oscillations in adaptive cells, Nat. Commun. 10, 5613 (2019).
5, S.-W. Wang, A.-F. Bitbol*, N. S. Wingreen*, Revealing evolutionary constraints on proteins through sequence analysis, PLOS Comput. Biol. 15, e1007010 (2019)
6, S.-W. Wang, K. Kawaguchi, S.-i. Sasa and L.-H. Tang, Entropy production of nanosystems with time scale separation, Phys. Rev. Lett. 117, 070601 (2016).

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