瀋陽農業大學植物免疫研究所（前身植物免疫研究室）由吳友三教授等老一代植物病理學家1956年創建，隸屬植物保護學院的集教學科研為一體的綜合科研單位。經過半個世紀的風雨考驗和幾代人的共同建設，現在已成為我國小麥稈鏽病的研究中心。
瀋陽農業大學植物免疫研究所現有研究人員8名，其中研究員和教授（博士生導師）2名，副研究員和副教授（碩士生導師）5名和講師1名（其中具有博士學位人員七名）；擁有面積3公頃，包括植保學科樓實驗室600平方米、作業室800平方米，溫室600平方米和科學試驗地1公頃；設有小麥病害、小麥抗病遺傳育種、玉米病害、水稻病害、蔬菜病害防治、生物農藥等研究方向和組織與細胞培養室和生物農藥發酵車間；是遼寧省農作物病害免疫重點開放實驗室的重要組成部分。
瀋陽農業大學植物免疫研究所從上個世紀七十年代初以來，以小麥病害和玉米病害為研究目標，承擔了國家小麥稈鏽病防治，小麥白粉病防治、小麥抗病育種、玉米病害防治、農藥殘留、生物農藥研製等省部級研究項目。曾獲1978年中國科技大會獎，國家“三委一部”的多次獎勵，獲得農業部科技進步一等獎、三等獎和多項省、市、廳級科技進步一、二、三等獎。“十二五”開始，隨著農業產業結構的調整，除保持傳統優勢項目外，拓展了小麥白粉病、玉米、水稻及設施作物病害、生物農藥等領域，先後承擔了國家（省）自然科學基金、國家重點研發計畫、國家（省）科技攻關、國家重大科技專項、國家應急防治計畫、國家博士點基金、國家863、農業部948引進項目及其他課題60餘項，獲國家級、省（部）級科技進步獎1項，培育出十多個小麥新品種。發表學術論文三百餘篇（SCI收錄55篇）。已培養博士後5名、博士研究生62名、碩士研究生186名及數百名本科畢業生。近年來獲得遼寧省優秀博士論文1篇，多篇博士研究生、碩士研究生及本科生獲得校級優秀論文獎勵。邀請了二十多位來自美國、加拿大、英國、澳大利亞、墨西哥、荷蘭、俄羅斯、日本、韓國的專家、教授來所講學與合作研究。派出十多人次赴美國、加拿大、韓國、墨西哥、日本、丹麥、俄羅斯舉行學術交流或做博士後研究。
瀋陽農業大學植物免疫研究所科研人員瞄準國際植物病理學科研究前沿與國家農業生產結構的改變，團結一致、努力拚搏，繼承傳統、與時俱進，為適應學科的高速發展，創建嶄新的教學科研平台而努力。
