澳門地區的內部審計開展得比較普遍，許多單位的內部審計制度很完善，例舉如下：
1．澳門公職人員福利會的內部審計制度。澳門公職人員福利會是具有行政和財政獨立，並擁有本身資產的法人，該福利會的宗旨是：為澳門公職人員提供補充性社會福利，如發給結婚及生育津貼；對因長期患病或須接受昂貴治療的會員提供協助及治療；對有困難的會員給予經濟援助等等。福利會下設三個部門；領導部門、諮詢委員會、核賬委員會。其中核賬委員會是內部審計機構。核賬委員會由三人組成：澳門總督委任財政司代表一人擔任核賬委員會主席；諮詢委員會委派代表一人；澳門總督委任公職人員福利會會員一人。核賬委員會的審計職權包括：檢查或修改預算以及對每年的賬目作出審計意見；關注福利會預算的執行及其財政管理；監督收支；對應呈報澳門總督批示的一切開支作出審計意見；對福利會主席提出的財政性質的問題作出審計意見；對接受贈與、遺產或饋贈作出審計意見；定期查核庫存之款項和存款，並審計賬冊。
2．澳門基金會的內部審計制度。預算基金會的宗旨是：直接或間接以文化和教育為目標，促進科學和技術研究。該基金會擁有自己的財產並享有管理權。澳門基金會第五部分港、澳、台特(地)區審計詞J 549 I_—一下設信託委員會、管理委員會、監事會三個部門。其中監事會負有審計職責，包括：審查賬目和結算，並發表審計意見；定期審查基金會的賬簿是否合乎規則。
3．澳門社會保障基金的內部審計制度。該基金是負責執行社會保障制度及管理有關資源的機構，具有行政和財政自治權。下設行政管理委員會、監事會。監事會由澳門總督在《政府公報》上公布委託三名成員組成，其中一人必須是註冊核數師。監事會的審計職責體現在：每個季度必須對社會保障基金的會計賬目及預算的執行情況審計一次；對會計賬目上的數額與財產價值的一致性進行審計。尤其注重審查有關部門的可動用資金，以及社會保障基金所有或由其保存的資產、有價物。
