深圳市環境監測中心站是深圳市人居環境委員會直屬單位。
1、對本市區域內的水體、大氣、土壤、固體廢物、水體底泥、生物、噪聲、振動、電磁輻射等各種環境要素的質量狀況進行定期監測；
2、對全市排污單位的排污狀況實施定期和不定期的監督性監測；
3、參加本市環境污染事故調查與應急監測，負責環境污染糾紛的技術仲裁監測和投訴監測；
4、承擔本市近岸海域的環境監測；
5、負責組織編寫環境質量報告書，編制本市環境監測月報、季報及監測年鑑；
6、負責市、區環境監測網路的業務技術指導；
7、承擔建設項目環境影響評價中的環境現狀監測與評價，負責建設項目竣工驗收及治理設施運行效果的監測；
8、負責本市“菜籃子”種植基地環境質量監測工作，為全市人民提供食品安全保障；
9、承擔和參與科研課題；
10、參加國家和地方環境標準的制訂和修訂，承擔國家和地方環境標準、技術規範、環境測試新技術和新方法研究等的驗證任務；
11、負責環境設備的檢測；
12、作為中國環境監測總站南海東站，負責廣東省近岸海域環境質量監測工作；
13、負責本市核與輻射定期監督性監管與監測工作；
14、負責環境污染與人體健康的相關監測；
15、建立與完善應急監測體系；
16、負責建立生態監測指標體系，套用遙感技術提升生態監測手段；協助制定本市生態監測規劃；
17、以合理適用的評價模型和形象直觀的表征形式為手段，清晰說明環境質量和環境污染的現狀及變化趨勢；對區域環境（珠三角）進行環境影響評價。
