楊若林

楊若林 ，男，1978年1月出生，湖南長沙縣人，博士，西北農林科技大學教授，博士生導師。

基本介紹

• 中文名：楊若林
• 國籍：中國
• 出生地：湖南長沙縣
• 出生日期：1978年1月
• 畢業院校：中國科學院
• 學位/學歷：博士
• 職業：教師
• 專業方向：比較和進化基因組學
• 任職院校：西北農林科技大學

人物經歷

1999年本科畢業於蘭州大學生物化學專業；2002年碩士畢業於蘭州大學細胞生物學專業。2002年至2005年任教於上海大學生命科學院。2005年到2008進入中科院昆明動物研究所遺傳資源與進化國家重點實驗室攻讀博士學位，研究方向為比較和進化基因組學。2009年至2011年8月在中科院遺傳和發育生物學研究所分子發育生物學國家重點實驗室從事進化－發育相關的博士後研究工作。2011年8月到2014年6月，在美國亞利桑那大學植物學系以博士後研究助理身份獨立開展植物比較和進化基因組學、基因組學和表觀遺傳學等研究工作。2014年8月作為西北農林科技大學高層次引進人才，被聘為教授。

研究方向

1. 比較和進化基因組學研究 2. 植物基因組和轉錄組學研究 3. 基因選擇性剪下的適應性進化 4. 生物信息學（文本挖掘技術在生物數據整合中的套用） 5. 生物信息學（基於序列的基因表達模式分析）

開設課程

擬承擔本科生遺傳學或群體遺傳學等相關的教學課程。擬為研究生開設分子進化與系統發育等相關的學術討論課。

主要論文

Xin M*, Yang R*, Li G, Chen H, Laurie J, Ma C, Wang D, Yao Y, Larkins BA, Sun Q, Yadegari R, Wang X, Ni Z. (2013) Dynamic Expression of Imprinted Genes Associates with Maternally Controlled Nutrient Allocation during Maize Endosperm Development. Plant Cell. Sep 20. [Epub ahead of print].

(*: equal contribution) Yang R*, Jarvis DE*, Chen H, Beilstein MA, Grimwood J, Jenkins J, Shu S, Prochnik S, Xin M, Ma C, Schmutz J, Wing RA, Mitchell-Olds T, Schumaker KS, Wang X. (2013) The Reference Genome of the Halophytic Plant Eutremasalsugineum. Frontiers Plant Sciences. 4: 46.

(*: equal contribution) Yang R, Wang X. (2013) Organ evolution in angiosperms driven by correlated divergences of gene sequences and expression patterns. Plant Cell. 25 (1): 71-82.

Yang R, Dai Z, Chen S, Chen L. (2011) MicroRNA-mediated gene regulation plays a minor role in the transcriptomic plasticity of cold-acclimated zebrafish brain tissue. BMC Genomics. 12: 605.

Yang R, Su B. (2010) Characterization and comparison of the tissue-related modules in human and mouse. PLoS ONE. 22;5 (7): e11730.

Han L*, Yang R*, Su B, Zhao Z. (2008) An SVM-based algorithm for classifying promoter-associated CpG islands in the human and mouse genomes. Lecture Notes in Artificial Intelligence (LNAI). 5227: 975-81.

(*: equal contribution) Yang R, Kong J, Wu X, Deng Z, Chen Q, Liu W. (2005) Application of ISSR markers in genetic polymorphism of Capsicum frutescens L. Journal of Shanghai University (Natural Science). 11: 423-6

Xin M*, Yang R*, Yao Y, Ma C, Peng H, Sun Q, Wang X, Ni Z. (2014) Dynamic parent-of-origin effects on small interfering RNA expression in the developing maize endosperm. BMC Plant Biology. 14(1):192.

(*: equal contribution) Li G*, Wang D*, Yang R*, Logan K, Chen H, Zhang S, Skaggs MI, Lloyd A, Burnett WJ, Laurie JD, Hunter BG, Dannenhoffer JM, Larkins BA, Drews GN, Wang X, Yadegari R. (2013) Temporal patterns of gene expression in developing maize endosperm identified through transcriptome sequencing. PNAS. 111(21):7582-7.

(*: equal contribution) Yang R, Su B. (2009) Modular organization in a cell: concepts and applications. Current Bioinformatics. 4: 207-217

Yang R, Chen H, Wang X. Distinct dynamics of transposable elements in the genome evolution of salt-tolerant and salt-sensitive Brassicaceae species (in preparation).