染色體片段代換系

染色體片段代換系(Chromosome Segment Substitution Lines, CSSL)群體是在F1代與輪迴親本進行多代的回交，然後通過對供體親本的染色體片段進行分子標記選擇得到的高代回交群體。

該群體後代自交不會發生性狀分離，可以穩定遺傳。群體內整個染色體組只存在少數幾個甚至一個代換片段差異?該群體與其受體親本間在遺傳背景上只有代換片段上的差異、是永久性分離群體、遺傳背景簡單可以用來進行多點、多年、多重複的實驗，QTL定位時可以消除其它背景的干擾，將QTL定位到很小的片段上、QTL定位的精確度高。所以CSSL群體近年來被廣泛用於QTL的精細定位及圖位克隆。它具有如下特點：1?單一性。每個片段代換系的基因組內只含有來自供體親本的染色體片段，且兩端由分子標記界定，基因組的其餘部分與輪迴親本相同。2?穩定性。可以提供大量的種子用於多點、多年、多重複的實驗?可以研究QTL與環境、QTL之間等的互作關係。3?單片段代換系可以通過再次回交?重組再分隔成代換片段長度更短的染色體單片段代換系，這樣就可以對QTL進行精細定位。片段代換系減少了遺傳背景的影響，大大提高了QTL定位的準確性，同時降低效應較大的QTL對效應較小的QTL的遮蓋作用，減少QTL之間的互作，從而使微效QTL被檢測出來。