人物經歷
學習經歷
1999-2003 信陽師範學院 學士 生物技術
2003-2009 北京大學 博士 植物學
工作經歷
2009.07-2013.10 助理研究員 中國林業科學研究院林業研究所
2013.11-2022.11 副研究員 中國林業科學研究院林業研究所
2015.03-2015.06 博士後 奧地利維也納農業與科學大學
2022.12-至今 研究員 中國林業科學研究院林業研究所
任職經歷
學會
2004年,北京植物學會(2004- )
2013年,北京植物學會第九屆理事會理事(2013-2018)
2014年,中國植物生理與植物分子生物學學會(2014- )
2016年,國際木材解剖學家協會(IAWA)(2016-2026)
2017年,中國林學會(2017- )
2017年,北京市科學技術協會第九次代表大會代表(2017- )
2018年,北京植物學會第十屆理事會理事(2018-2022)
2018年,中國植物學會植物結構與生殖生物學專業委員會委員(2018-2023)
2021年,中國植物學會高級會員(2021-2026)
2023年,北京植物學會第十一屆理事會理事(2023-2028)
機構
國家自然科學基金委員會(2016- )
北京市自然科學基金委員會(2018-)
教育部學位與研究生教育發展中心(2022- )
期刊
《Forestry Research》 Associate Editors (2022-)
《Forests》 Guest Editor (2022-2023)
《Plant Science》 Guest Editor (2023-2024)
《Agronomy》、《Biotechnology Reports》、《BMC Genomics》、《BMC Plant Biology》、《Canadian Journal of Forest Research》、《Current Bioinformatics》、《Forestry Research》、《Forests》、《Frontiers in genetics》、《HortScience》、《Industrial Crops and Products》、《International Journal of Molecular Sciences》、《International Journal of Plant Biology》、《iScience》、《Journal of Experimental Botany》、《Journal of Forestry Research》、《Journal of Genetic Engineering and Biotechnology》、《Journal of Plant Physiology》、《Molecular Biology Reports》、《Nature Communications》、《Physiologia Plantarum》、《Plant, Cell & Environment》、《Plant Cell Tissue and Organ Culture》、《Plant Methods》、《Plant Molecular Biology Reporter》、《Plant Science》、《Plants》、《Tree Genetics & Genomes》、《Trees-Structure and Function》、《核農學報》、《基因組學與套用生物學》、《林業科學研究》、《西南林業大學學報》、《浙江農林大學學報》、《植物科學學報》、《植物生理學報》、《中國科學 生命科學》
科普
公眾號:林間小品
出國經歷
2013.07.24-08.01 芬 蘭 赫爾辛基 第三屆植物維管生物學國際大會(PVB 2013)
2018.09.09-09.16 葡萄牙 科英布拉 第五屆IUFRO工作組會議2.09.02
2019.09.29-10.08 巴 西 庫里蒂巴 第二十五屆世界林聯國際大會
2024.03.02-03.09 紐西蘭 羅托魯瓦 第六屆IUFRO工作組會議2.09.02
研究方向
林木繁育技術與調控
科研項目
[11]抗松材線蟲病高產落葉松新品種設計與培育(2022ZD0401602)(主持)
科技創新2030課題,2022.12-2025.12
[10] 落葉松miR171-LaSCL6調控體胚發生的分子機理(32271904)(主持)
國家自然科學基金面上項目,2023.01-2026.12
[9] 落葉松形成層活動中CDKB、CYCB表達調控和功能研究(31770714)(主持)
國家自然科學基金面上項目,2018.01-2021.12
[8] 日本落葉松豐產增效技術集成與示範 (2017YFD0601204-2) (主持)
國家重點研發計畫子課題,2017.07-2020.12
[7] 落葉松花粉管雜交轉化及轉基因新種質篩選(2018ZX08020003-004-002)(主持)
國家科技重大專項任務,2018.01-2020.12
[6] 年齡影響落葉松生長素應答反應的分子機理(31200464)(主持)
青年科學基金項目,2013.01-2015.12
[5] 輪伐期內miRNA調控落葉松階段轉變的機理研究(RIF2014-07)(主持)
中央級公益性科研院所基本科研業務費專項資金項目,2014.04-2016.04
[4] 落葉松階段轉變相關的miRNA調控網路及其演化(CAFYBB2017SY006)(參加)
中央級公益性科研院所基本科研業務費專項資金項目,2016.12-2018.11
[3] 落葉松、馬尾松、杉木分子育種及品種創製(2011AA100203)(參加)
國家高技術研究發展計畫(863計畫)課題,2011.01-2015.12
[2] 白樺、落葉松轉基因育種技術研究(2013AA102704)(參加)
國家高技術研究發展計畫(863計畫)課題,2013.01-2017.12
[1] 落葉松幹細胞發育關鍵MicroRNAs功能分析及其TALEN定向突變體創製(31330017)(參加)
國家自然科學基金重點項目,2014.01-2018.12
獲獎記錄
2019 林業研究所2019年度青年優秀論文二等獎
2018 林業研究所2018年度青年優秀論文二等獎
2017 林業研究所2017年度青年優秀論文二等獎
2014 林業研究所2014年度青年優秀論文二等獎
2012 林業研究所2012年度青年優秀論文二等獎
2009 植物維管生物學與農業國際會議BEST POSTER AWARD
2008 第八屆中國林業青年學術年會優秀學術報告獎
2006 第七屆北方七省(市、自治區)植物學學術論壇 蔡司優秀研究生論文獎二等獎
所獲成就
專利
[2] 李萬峰, 葉查龍, 臧巧路, 等. 與縮短落葉松育種周期相關的蛋白及其套用: 2023-05-16.
[1] 李萬峰, 黃宗鈉, 臧巧路, 等. 一種與落葉鬆開花時間相關的LaSCL6蛋白及其編碼基因和套用: 2023-03-17.
軟體著作權
[1] 李萬峰,廖堂全. RNA-Seq實驗標準分析軟體V1.1.0 (登記號:2025SR1022304).
發表論文
2025年
[68] Ye Zha-Long, Liao Tang-Quan, Wang Yue, Sun Sheng-Ying, Bai Shu-Nong, Sun Xiao-Mei, Li Wanfeng. Revisiting the proliferated seed cones in Larix kaempferi reveal a growth arrest plasticity. Plant Direct, 2025, 已接受.
[67] 孫海濤,楊玲,程冬霞,齊力旺,李萬峰. 黑暗下萌發培養促進日本落葉松胚狀體苗的形態建成. 溫帶林業研究,2025,8(3).
[66] 楊曉羽,葉查龍,楊劍飛,楊玲,李萬峰. 日本落葉松體胚苗移栽基質初篩. 林業科技通訊,2025,已接受.
[65] Ye Zha-Long, Li Xiang-Yi, Cheng Dong-Xia, Li Wan-Feng. Different expression patterns and interactions with time recorder DAL1 revealed the gene expansion and functional differentiation of flowering integrator SOC1 during larch aging. Journal of Plant Growth Regulation, 2025.
本文通過分析落葉松SOC1基因隨樹齡的表達變化及其與DAL1的互作模式,不僅揭示了其基因擴張及功能分化機制,也進一步解析了落葉松階段轉變的分子機制。我們發現落葉松擁有7個SOC1基因,隨樹齡增加,它們的表達呈現不同模式。SOC1-1、SOC1-2、SOC1-3、SOC1-6和SOC1-7的表達隨樹齡增加而上升,SOC1-5在1年和7年時表達最多,SOC1-4的表達幾乎沒有變化。此外,發現SOC1-3、SOC1-5和SOC1-6能夠與DAL1互作,而其他四個SOC1不能夠與DAL1互作。這些發現深化了對落葉松階段轉變分子機制的理解。
[64] Xing Jun-Xia, Luo Ao-Jie, Wang Xin-Hao, Ding Qi, Yang Ling, Li Wan-Feng. Identification of U6 promoter and establishment of gene-editing system in Larix kaempferi (Lamb.) Carr. Plants, 2025, 14(1):45.
該研究在日本落葉松中成功建立了CRISPR/Cas9基因編輯系統,並發現內源LaU6基因的啟動子驅動sgRNA表達能達到更高的編輯效率。該技術體系的建立為松樹生物育種提供了新工具,使日本落葉松新性狀的引入及現有性狀的改良成為可能。
[63] Shen Jinbo, Li Wan-Feng, Liu Chang, Zheng Shuai. Tree biology: from genomics to genetic improvement. Plant Science, 2025, 350:112315.
2024年
[62] Zang Qiao-Lu, Ye Zha-Long, Qi Li-Wang, Li Wan-Feng. Identification of target gene and interacting protein of two LaSCL6 alternative splicing variants provides novel insights into larch somatic embryogenesis. Plants, 2024,13(21):3072.
該研究通過分析LaSCL6-var1和LaSCL6-var2的靶基因和互作蛋白,解析了microRNA171-LaSCL6調控體胚發生的分子機制。確定LaSCL6-var1的靶基因為LaCYP89A5和LaWAKL20,LaSCL6-var2的靶基因為LaWAKL20和LaUGT85A3,LaSCL6-var1和LaSCL6-var2均可與LaAP2L2發生互作。根據得到的靶基因和互作蛋白,並結合課題組以往的研究結果,完善了落葉松LaSCL6的調控網路。在基因組水平上,SSR和SNP可以影響LaSCL6的表達;轉錄後水平上,LaSCL6受miR171和可變剪接影響;在翻譯水平上,LaSCL6可以和LaAP2L2互作。該調控網路有助於理解miR171-LaSCL6調控落葉松體胚發生和其他生物學過程的分子機制。
[61] Zhang Chen-Yi, Ye Zha-Long, Qi Li-Wang, Yang Ling, Li Wan-Feng. Screening and functional evaluation of four Larix kaempferi promoters. Plants, 2024,13(19):2777.
該研究通過分析日本落葉松轉錄組數據,得到4個高表達基因,隨後克隆其啟動子進行分析。日本落葉松穩定轉化後,在轉化的材料中可檢測到GUS基因的擴增片段和表達,且pLaUBQ啟動子驅動時GUS基因表達量最高、表達最快。研究結果為落葉松生物育種提供了一個強有力的工具。
[60] Xing Jun-Xia, Zang Qiao-Lu, Ye Zha-Long, Qi Li-Wang, Yang Ling, Li Wan-Feng. Overexpression of larch SCL6 inhibits transitions from vegetative meristem to inflorescence and flower meristem in Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. Plants, 2024,13(9):1232.
該研究通過分析LaSCL6-var1和LaSCL6-var2過表達擬南芥的表型,探究了LaSCL6在生命周期運轉過程中的功能。發現LaSCL6過表達植株的幼年期和生命周期更長。總的來說,轉基因植株的壽命延長了大約5天。研究結果豐富了落葉松SCL6的功能信息。
[59] 胡勐鴻, 呂尋, 戴小芬, 李宗德, 李萬峰. 日本落葉松無性系種子園和優樹半同胞家系苗期比較. 東北林業大學學報, 2024, 52(12):10-17.
[58] 胡勐鴻, 李萬峰, 呂尋, 戴小芬, 李宗德, 周卓玲. 日本落葉松種子園和人工林優樹自由授粉家系苗期選擇. 森林工程, 2024, 40(06):64-78.
[57] 葉查龍, 張陳誼, 楊玲, 孫曉梅, 李萬峰. 日本落葉松內源GUS基因鑑定及其酶活性分析. 林業科學研究, 2024, 37(06):86-92.
[56] 王昕昊, 邢俊霞, 史勝青, 楊玲, 李萬峰. 日本落葉松SNP和INDEL位點及其所在抗生物脅迫基因挖掘. 林業科學研究, 2024,37(5):54-64.
[55] Ye Zha-Long, Liu Jin-Yi, Feng Jian, Li Wan-Feng. Transcriptome analysis provides insights into Korean pine tree aging and response to shading. Forests, 2024,15(2):291.
本文取了5年、7年、10年、14年和17年的紅松,以及林冠下造林和正常生長的14年和17年的紅松,一共9組材料,進行生長指標調查和轉錄組測序。鑑定到了脅迫應答相關基因和熱激蛋白的表達與年齡變化相關,並受到林冠下造林的影響。此外,落葉松、雲杉、油松中鑑定到的年齡標記基因DAL1在紅松中也存在。該工作為理解林冠下造林和年齡效應對紅松生長的影響提供了基礎。
[54] Cheng Dong-Xia, Wang Xin-Hao, Wang Cong-Li, Li Xiang-Yi, Ye Zha-Long, Li Wan-Feng. Cambium reactivation is closely related to the cell-cycle gene configuration in Larix kaempferi. International Journal of Molecular Sciences, 2024,25(7):3578.
本文探究了冬季低溫和春季溫度對日本落葉松休眠解除和恢復活動的調控機制。發現低溫處理可以整體加速幼苗發芽,30天低溫能滿足落葉松的冬季低溫需求。發現12個細胞周期基因的表達水平在活動期高,休眠期低,和春季溫度之間存在正相關關係。發現落葉松枝條發芽所需時間和年齡呈負相關,說明年齡影響落葉松休眠芽恢復活動。提出並利用基因配置值定量分析細胞周期基因表達和細胞分裂的關係。在活動期,形成層細胞分裂旺盛,細胞周期基因配置值都在9.44以上,而在休眠期,形成層細胞停止分裂,配置值都在4.66以下;春季恢復活動過程中,配置值逐漸升高,當形成層細胞開始分裂時,配置值為4.97。因此4.97可以作為形成層細胞分裂時的配置閾值。水培實驗進一步驗證了這一結果。休眠枝條水培1周后,1年生和4年生的落葉松中配置值分別增加了5.33和5.39,高於其它年齡段的配置值增加量,說明細胞周期基因配置過程受年齡影響,構成了年齡影響落葉松恢復活動的分子基礎。該工作不僅有助於闡述溫度協同調控樹木恢復活動的分子基礎,還為林分管理和溫室苗木培育提供技術支撐。
[53] 邢俊霞, 臧巧路, 葉查龍, 張陳誼, 程冬霞, 齊力旺, 楊玲, 李萬峰. 日本落葉松瞬時轉化體系的最佳化及初步套用. 林業科學研究, 2024, 37(3):129-135.
[52] 孫海濤, 楊玲, 齊力旺, 李萬峰. 日本落葉松胚狀體乾化處理對萌發的影響. 林業科學研究, 2024, 37(2):90-95.
[51] 呂尋, 李萬峰, 胡勐鴻, 戴小芬, 成紅梅, 委霞. 日本落葉松種子園和優樹自由授粉家系選擇與利用研究. 西南林業大學學報, 2024,44(6):1-9.
[50] 王昕昊, 戰金偉, 陳若楠, 劉金義, 程冬霞, 李萬峰. 日本落葉松苗木繁育技術進展. 林業科技通訊, 2024,(08):17-21.
2023年
[49] 胡勐鴻, 呂尋, 李萬峰, 戴小芬. 日本落葉松種子園和人工林優樹自由授粉家系試驗林比較. 溫帶林業研究, 2023,6(2):8-16.
[48] 胡勐鴻, 李萬峰, 呂尋. 日本落葉松自由授粉家系選擇和無性繁殖利用. 溫帶林業研究, 2023,6(1):7-16.
[47] Xiangyi Li, Dongxia Cheng, Liwang Qi, Jinwei Zhan, Wanfeng Li. (2023) Regulation of age-dependent expression patterns of five transcription factors in Larix kaempferi. Forestry Research 3:18 doi: 10.48130/FR-2023-0018
該研究利用之前鑑定到的日本落葉松年齡相關轉錄因子,對其年齡依賴表達模式的形成進行了研究。首先分析了年齡相關轉錄因子的基因結構,從而設計了特定的定量PCR引物,分別用於檢測pre-mRNA和spliced mRNA在年齡增加過程中的表達模式。檢測結果顯示,pre-mRNA轉錄和剪接都參與了年齡依賴表達模式的形成。本研究為理解多年生木本植物的生長發育規律提供了新的見解。
[46] Gui-Yun Tao, Yun-Hui Xie, Wan-Feng Li, Kui-Peng Li, Chao Sun, Hong-Ming Wang, and Xiao-Mei Sun. (2023) LkARF7 and LkARF19 overexpression promote adventitious root formation in a heterologous poplar model by positively regulating LkBBM1. Communications Biology, 6(1): 372. doi: 10.1038/s42003-023-04731-3
[45] Xiang-Yi Li, Zha-Long Ye, Dong-Xia Cheng, Qiao-Lu Zang, Li-Wang Qi, and Wan-Feng Li.(2023) LaDAL1 Coordinates Age and Environmental Signals in the Life Cycle of Larix kaempferi. International Journal of Molecular Sciences 24, no. 1: 426. https://doi.org/10.3390/ijms24010426
通過檢測LaDAL1轉錄水平隨時間的變化及其對環境信號的應答,發現LaDAL1受到年齡和環境共同調控,並且LaDAL1的轉錄水平與落葉松生命周期運轉相協調。在種子萌發後,LaDAL1的轉錄水平略微升高,幼苗期仍舊較低;在落葉松3-5年時驟增,這可能是營養階段轉變的分子特徵,隨後維持在較高水平;在有性生殖過程中,LaDAL1的轉錄水平在減數分裂和胚胎髮生過程中依次下降。作為年齡信號的信使,LaDAL1通過整合外界環境信號參與調控落葉松的生命周期運轉。減數分裂迅速降低年齡信號,胚胎髮育過程中年齡信號重置為“0”,隨著種子萌發,下一個世代重啟,年齡也重新開始計數。我們的發現為在整個生命周期內理解多年生木本植物的生長發育提供了新的見解。
2022年
[44] Zha-Long Ye, Qiao-Lu Zang, Dong-Xia Cheng, Xiang-Yi Li, Li-Wang Qi, and Wan-Feng Li. (2022) Over-Expression of Larch DAL1 Accelerates Life-Cycle Progression in Arabidopsis. Forests 13, no. 6: 953. https://doi.org/10.3390/f13060953
為了詳細地研究LaDAL1的功能,我們比較了多年生植物和一年生植物的生命周期運轉過程,發現有許多類似之處。因此,我們依據分生組織的狀態對擬南芥的生命周期運轉過程進行了詳細的劃分,並以此為依據分析了LaDAL1過表達擬南芥生命周期運轉過程的變化。結果表明,LaDAL1促進了擬南芥種子萌發、抽薹、開花、整體分裂活動停止。另外,我們還發現LaDAL1下調分生組織marker基因TFL1的表達。這些都表明LaDAL1能促進分生組織命運轉變,不僅幫助我們更加全面、深刻地認識了LaDAL1的功能,而且也為利用基因工程手段去改良落葉松等植物的生殖性狀提供了候選基因。
[43] Wan-Feng Li, Li-Wang Qi, Wen-Hua Yang (2022) Age-related miRNA-mediated regulatory networks orchestrating chronological development of meristems in Larix Kaempferi. Journal of Plant Growth Regulation 41(6):2305-2318. https://doi.org/10.1007/s00344-021-10436-w
該論文以日本落葉松為研究對象,分析了小RNA組中與年齡緊密關聯的miRNA及其靶基因,構建了miRNA的分子調控網路,包括miR156、miR397和miR166等與有性生殖、木材形成和分生組織活動密切相關的小RNA。這些結果成為我們繼續研究落葉松形成層活動、木材形成和生殖發育的新起點。
2021年
[42] Kang Y, Li W, Zhang L, Qi L (2021) Over-expression of the cell-cycle Gene LaCDKB1;2 promotes cell proliferation and the formation of normal cotyledonary embryos during Larix kaempferi somatic embryogenesis. Genes 12(9):1435. https://doi.org/10.3390/genes12091435
本文分析了LaCDKB1;2在體細胞胚胎髮生過程中的表達模式及其與細胞增殖率的關係,測定了LaCDKB1;2過表達對體細胞胚質量的影響,發現LaCDKB1;2不僅增加了胚性細胞的增殖和體細胞胚數量,而且提高了體細胞胚的質量。這些結果不僅為體細胞胚胎髮生的調控機制提供了更多的見解,而且為落葉松育種提供了新的材料。
[41] Fan Y, Li W, Li Z, Dang S, Han S, Zhang L, Qi L (2021) Examination of the transcriptional response to LaMIR166a overexpression in Larix kaempferi (Lamb.) Carr. Biology 10(7): 576.
通過對過表達miR166a的胚性細胞系進行miR166活性和RNA-seq分析,以及酵母單雜交和雙螢光素酶報告實驗,發現miR166a的靶基因LaHDZ31-34可以結合到LaPAP、LaPP1、LaZFP5和LaPHO1的啟動子上並調控它們的表達,進一步揭示了miR166調控體胚發生的分子機理。
[40] Wan-Feng Li, Yanhui Kang, Yao Zhang, Qiao-Lu Zang, Li-Wang Qi (2021) Concerted control of the LaRAV1-LaCDKB1;3 module by temperature during dormancy release and reactivation of larch. Tree Physiology 41(10):1918–1937. https://doi.org/10.1093/treephys/tpab052
溫帶地區樹木的休眠解除和恢復活動過程與細胞周期基因的表達調控密切相關。然而,溫度調控細胞周期基因表達的具體機制還不清楚。該論文比較了落葉松活動期和休眠期的轉錄組,著重分析了細胞周期基因和轉錄因子的表達、它們之間的關係以及對溫度的回響。結果表明,12個細胞周期基因和31個轉錄因子(17個家族)在活動期高表達,說明它們之間可能存在調控關係;啟動子分析表明,12個細胞周期基因可能受到10個轉錄因子家族的調控;綜合分析顯示,來自7個家族的16個轉錄因子與10個細胞周期基因之間可能存在73個調控事件,而酵母單雜交和雙螢光素酶實驗證實了其中的2個,涉及到2個轉錄因子(LaMYB20和LaRAV1)和2個細胞周期基因(LaCDKB1;3和LaCYCB1;1)。最後,該論文發現LaRAV1和LaCDKB1;3在溫度誘導的休眠解除和恢復活動過程中具有相同的表達模式,進一步表明它們參與落葉松的休眠解除和恢復活動過程。這些結果不僅有助於解析溫度調控細胞周期基因表達的具體機制,也有助於理解氣候變化背景下溫度調控樹木生長發育的機理,為林木培育提供理論基礎。
[39] 任玉東, 李萬峰 (2021) 日本落葉松輕基質網袋育苗及造林技術的優勢分析. 林業科技通訊: 1-5.
[38] 任玉東, 李萬峰 (2021) 間伐次數與林分密度的關係以及對日本落葉松大徑木林培育產生的效應分析. 林業科技通訊: 1-4.
[37] Zang QL, Zhang Y, Han SY, Li WF, Qi LW (2021) Transcriptional and post-transcriptional regulation of the miR171-LaSCL6 module during somatic embryogenesis in Larix kaempferi. Trees 35:145–154.
鑑定了落葉松中5個miR171家族成員,發現不同的miR171成員在不同位點切割靶基因LaSCL6的mRNA;改進了顯示miR171的活性的方法,並檢測到落葉松中胚性細胞比非胚性細胞中miR171的活性高,原胚時期比體胚成熟時期miR171的活性更高;值得注意的是,不同的miR171在合成過程中的不同階段受到調控,並最終導致其水平和活性的不同。
[36] Ren Q, Sretenovic S, Liu S, Tang X, Huang L, He Y, Liu L, Guo Y, Zhong Z, Liu G, Cheng Y, Zheng X, Pan C, Yin D, Zhang Y, Li W, Qi L, Li C, Qi Y, Zhang Y (2021) PAM-less plant genome editing using a CRISPR–SpRY toolbox. Nature Plants 7(1): 25-33.
本文建立了基於CRISPR-SpRY介導的落葉松基因組編輯體系,針對落葉松內源基因進行有效的單位點、多位點編輯,編輯效率達到20%以上,首次實現落葉松的內源基因的高編輯活性。
2020年
[35] Zang QL, Li XY, Qi LW, Li WF (2020) Identification and characterization of LaSCL6 alleles in Larix kaempferi (Lamb.) Carr. based on analysis of simple sequence repeats and allelic expression. Forests 11(12),1296.
分析了LaSCL6兩個SSRs(GCA和CCA)在日本落葉松群體中的多態性,發現它們各有5種類型,共檢測到12個LaSCL6的單倍型。檢測了LaSCL6在落葉松母樹及其種子中的單倍型,並分析了它們在親本與子代中的關係。進一步分析了5個LaSCL6等位基因的表達模式,發現它們在營養發育過程中表達模式幾乎一樣,表明它們的表達是平衡的。這些發現為了解LaSCL6的功能提供了更多的信息,有助於進行落葉松的遺傳改良。
[34] Zhang Y, Zang QL, Qi LW, Han SY, Li WF (2020) Effects of cutting, pruning, and grafting on the expression of age-related genes in Larix kaempferi. Forests 11(2), 218
本文通過研究年齡相關基因的表達模式,闡述了落葉松復幼的分子機理。重新分析了生殖階段轉變相關的27個轉錄因子。根據基因表達隨年齡的變化,確定了6個年齡相關基因,檢測了它們對扦插、嫁接和整形修剪的回響。發現扦插和整形修剪促使植物復幼的同時,還可影響基因的表達,這種影響在14年後還可以被檢測到;嫁接後3個月內,砧木更易受接穗的影響而變成熟;6個基因對嫁接的回響不同。這有助於揭示復幼的分子機理。
[33] Li H, Huang X, Li W, Lu Y, Dai X, Zhou Z, Li Q (2020) MicroRNA comparison between poplar and larch provides insight into the different mechanism of wood formation. Plant cell reports 39(9): 1199-1217
2019年
[32] Xiang WB, Li WF, Zhang SG, Qi LW (2019) Transcriptome-wide analysis to dissect the transcription factors orchestrating the phase change from vegetative to reproductive development in Larix kaempferi. Tree Genetics & Genomes 15: 68
本文通過比較幼年期和成年期的轉錄組,闡述了落葉松生殖階段轉變的轉錄調控機理。鑑定出落葉松55個家族的4377個轉錄因子。基於幼年期和成年期差異表達的27個轉錄因子的功能注釋,提出了落葉松生殖階段轉變的調控網路模型:為利用分子手段去改變結實時間提供候選基因,也為檢測植物的年齡狀態提供分子標記;有助於理解多年生木本裸子植物的有性生殖發育過程。
[31] Zang QL, Li WF, Qi LW (2019) Regulation of LaSCL6 expression by genomic structure, alternative splicing, and microRNA in Larix kaempferi. Tree Genetics & Genomes 15: 57
本文從基因結構、可變剪下和miRNA層面揭示了落葉松LaSCL6的表達調控機制。發現LaSCL6具有2種不同的可變剪接體,DNA序列中存在簡單的序列重複(SSR)和單核苷酸多態性(SNP),且它們可能導致2個可變剪接體的產生和三級結構的改變;再次驗證LaSCL6轉錄後還受到miR171的調控;表明LaSCL6的表達受多種機制調控,為理解LaSCL6的表達調控提供了一新視角。
2018年
[30] Li ZX, Fan YR, Dang SF, Li WF, Qi LW, Han SY (2018) LaMIR166a-mediated auxin biosynthesis and signalling affect somatic embryogenesis in Larix leptolepis. Molecular Genetics and Genomics 293(6): 1355–1363
2017年
[29] Li WF, Yang WH, Zhang SG, Han SY, Qi LW (2017) Transcriptome analysis provides insights into wood formation during larch tree aging. Tree Genetics & Genomes 13: 19
本文通過研究輪伐期內落葉松形成層區域結構和轉錄組變化,闡述了年齡影響形成層活動和木材形成的機理。(1) 確定了落葉松輪伐期內形成層活動規律:通過檢測活動期不同年齡落葉松頂端主幹的木材形成情況,發現形成層區域細胞層數隨著樹齡的增加先增加而後減少,這和木質部寬度的變化趨勢一致,表明年齡影響形成層活動和管胞擴展,為研究細胞分裂和分化間的平衡和協調提供了一個很好的實驗體系。(2) 系統分析了輪伐期內落葉松木材形成過程及其調控:分析了活動期不同年齡落葉松頂端主幹的轉錄組變化,發現在生長早期,細胞分裂、分化相關的基因表達上升;而在後期,這些基因都下調錶達。這和觀測到的形態結果一致,表明輪伐期內樹木年齡的增加過程伴隨著形成層細胞分裂、分化活動的改變。(3) 以乙烯合成和信號轉導為核心,提出了管胞生長調控網路模型:有助於研究裸子植物的木材形成過程,為利用分子手段去改變木材品質提供候選基因。
[28] Li ZX, Zhang LF, Li WF, Qi LW, Han SY (2017) MIR166a affects the germination of somatic embryos in Larix leptolepis by modulating IAA biosynthesis and signaling genes. Journal of Plant Growth Regulation 36(4): 889–896
[27] 武苾菲,李萬峰,徐海燕,張立峰,齊力旺,韓素英 (2017) 中間錦雞兒CiDR1的克隆及乾旱脅迫下的表達分析.林業科學研究 30(2):238-244
[26] 李哲馨,李萬峰,韓素英,齊力旺 (2017) 落葉松體細胞胚萌發能力研究.林業科學研究 30(6): 999-1003
2016年
[25] Liu Y, Han S, Ding X, Li X, Zhang L, Li W, Xu H, Li Z, Qi L. (2016) Transcriptome analysis of mRNA and miRNA in somatic embryos of Larix leptolepis subjected to hydrogen treatment. International Journal of Molecular Sciences 17(11): 1951.
[24] Li ZX, Li SG, Zhang LF, Han SY, Li WF, Xu HY, Yang WH, Liu YL, Fan YR, Qi LW (2016) Over-expression of miR166a inhibits cotyledon formation in somatic embryos and promotes lateral root development in seedlings of Larix leptolepis. Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) 127:461-473
2015年
[23] Wu BF, Li WF, Xu HY, Qi LW, Han SY (2015) Role of cin-miR2118 in drought stress responses in Caragana intermedia and Tobacco. Gene 574:34–40
2014年
[22] Li W, Han S, Qi L, Zhang S (2014a) Transcriptome resources and genome-wide marker development for Japanese larch (Larix kaempferi). Frontiers of Agricultural Science & Engineering 1: 77-84
以1年、2年、5年、10年、25年和50年樹齡的落葉松頂端主幹為材料,構建文庫,進行測序,獲得的序列和已有的落葉松體胚轉錄組序列進行拼接,共獲得14,6786條ESTs,其中有7,9182條得到注釋。GO注釋表明輪伐期內樹木年齡的增加過程伴隨著分生組織細胞命運的改變,多種激素參與調控分生組織活動和細胞壁形成。首次以落葉松的莖為材料進行測序,獲得的序列實現了共享,為落葉松的功能基因組學研究和材性分子育種提供了序列資源。
[21] Li WF, Zhang SG, Han SY, Wu T, Zhang JH, Qi LW (2014b) The post-transcriptional regulation of LaSCL6 by miR171 during maintenance of embryogenic potential in Larix kaempferi (Lamb.) Carr. Tree Genetics & Genomes 10: 223-229
確定miR171的靶基因LaSCL6在轉錄後水平上的調控參與落葉松體胚發生。
[20] Zhang JH, Zhang SG, Li SG, Han SY, Li WF, Li XM, Qi LW (2014a) Regulation of synchronism by abscisic-acid-responsive small noncoding RNAs during somatic embryogenesis in larch (Larix leptolepis). Plant Cell Tiss Organ Cult 116: 361-370
[19] Zhang LF, Li WF, Xu HY, Qi LW, Han SY (2014b) Cloning and characterization of four differentially expressed cDNAs encoding NFYA homologs involved in responses to ABA during somatic embryogenesis in Japanese larch (Larix leptolepis). Plant Cell Tiss Organ Cult 117: 293-304
2013年
[18] Li WF, Ding Q, Cui KM, He XQ (2013a) Cambium reactivation independent of bud unfolding involves de novo IAA biosynthesis in cambium regions in Populus tomentosa Carr. Acta Physiol Plant 35: 1827-1836
發現毛白楊形成層細胞恢復分裂活動可以不依賴於芽,或外源IAA。自由態IAA的含量在楊樹沒有發芽、長葉的2月份已經升高,IAA合成通路中的關鍵酶基因PtoAO2 (aldehyde oxidase) 和PtoNIT2 (nitrilases) 的表達量也逐漸升高。表明生長素的合成在形成層恢復活動過程中逐漸增強,為形成層細胞恢復分裂提供必要的信號分子。研究結果闡明了形成層恢復活動早於芽展開的原因,同時也給出了樹木莖中能夠合成IAA的直接實驗證據,這可能也是環孔材樹木和部分散孔材樹木形成層早於葉芽恢復活動的原因。
[17] Li WF, Zhang SG, Han SY, Wu T, Zhang JH, Qi LW (2013b) Regulation of LaMYB33 by miR159 during maintenance of embryogenic potential and somatic embryo maturation in Larix kaempferi (Lamb.) Carr. Plant Cell Tiss Organ Cult 113: 131-136
確定miR159的靶基因LaMYB33在轉錄水平上的調控參與落葉松體胚發生,給出了一種檢測miRNA活性的方法。
[16] Li SG, Li WF, Han SY, Yang WH, Qi LW (2013c) Stage-specific regulation of four HD-ZIP III transcription factors during polar pattern formation in Larix leptolepis somatic embryos. Gene 522: 177-183
[15] Zhang LF, Li WF, Han SY, Yang WH, Qi LW (2013) cDNA cloning, genomic organization and expression analysis during somatic embryogenesis of the translationally controlled tumor protein (TCTP) gene from Japanese larch (Larix leptolepis). Gene 529: 150-158
[14] Zhu J, Li W, Yang W, Qi L, Han S (2013a) Identification of microRNAs in Caragana intermedia by highthroughput sequencing and expression analysis of 12 microRNAs and their targets under salt stress. Plant Cell Rep 32: 1339-1349
[13] Zhu J, Zhang L, Li W, Han S, Yang W, Qi L (2013b) Reference Gene Selection for Quantitative Real-time PCR Normalization in Caragana intermedia under Different Abiotic Stress Conditions. PLoS ONE 8: e53196
[12] 吳濤,李萬峰,張俊紅,齊力旺.落葉松實時定量PCR內參基因的篩選.林業科學研究 (2013) 26:1-8. (共同第一作者)
[11] 朱建峰,李萬峰,楊文華,齊力旺.中間錦雞兒生長發育過程中5個miRNAs及其目標基因的表達模式分析.林業科學研究 (2013) 26:45-51.
[10] 張俊紅,張守攻,童再康,李萬峰,韓素英,齊力旺.植物中MicroRNA及其它非編碼小RNA的保守性和進化歷程.林業科學研究 (2013) 26:103-108.
[9] 吳濤,韓素英,張俊紅,李萬峰,楊文華,齊力旺.日本落葉松種子萌發過程中18個miRNAs的表達變化.林業科學研究 (2013) 26:9-17.
2012年
[8] Zhang J, Zhang S, Han S, Wu T, Li X, Li W, Qi L (2012a) Genome-wide identification of microRNAs in larch and stage-specific modulation of 11 conserved microRNAs and their targets during somatic embryogenesis. Planta 236: 647-657
[7] Zhang S, Han S, Li W, Zhou J, Li X, Qi L (2012b) miRNA regulation in fast- and slow-growing hybrid Larix trees. Trees 26: 1597-1604
[6] 吳濤,張俊紅,韓素英,楊文華,李萬峰,齊力旺.日本落葉松小RNA文庫構建及其microRNA鑑定.林業科學研究 (2012) 25(6):677-684
2011年
[5] 魏華麗,吳濤,楊文華,李萬峰,張俊紅,齊力旺,韓素英.落葉松體細胞胚胎髮生過程中DNA 甲基化模式變化分析.東北林業大學學報 (2011) 39(2):33-37
2010年
[4] Zhang S, Zhou J, Han S, Yang W, Li W, Wei H, Li X, Qi L (2010) Four abiotic stress-induced miRNA families differentially regulated in the embryogenic and non-embryogenic callus tissues of Larix leptolepis. Biochem Biophys Res Commun 398: 355-360
2009年以前
[3] Li WF, Cui KM, He XQ (2009a) Regulation of cell cycle regulators by environmental signals during growth-dormancy cycle of trees. Plant Signal Behav 4: 959-961
闡述了樹木季節性活動過程中環境信號(溫度和光照時間)對細胞周期基因的調控,指出春季溫度對PtoCDKB和PtoCYCB的誘導表達依賴於冬季低溫的作用。
[2] Li WF, Ding Q, Chen JJ, Cui KM, He XQ (2009b) Induction of PtoCDKB and PtoCYCB transcription by temperature during cambium reactivation in Populus tomentosa Carr. J Exp Bot 60: 2621-2630
本文通過研究毛白楊形成層區域PtoCDKB和PtoCYCB的表達模式與環境溫度的關係,揭示了環境溫度調控形成層細胞季節性活動的分子機理。證實溫度是誘導PtoCDKB和PtoCYCB在早春重新表達的主要環境因子,同時也證明了形成層細胞本身可以感受到這種環境信號。發現PtoCDKB和PtoCYCB的誘導表達不依賴於外源生長素(IAA)和休眠的階段,對於PtoCDKB,外源脫落酸(ABA)也不能抑制這種誘導。
[1] Hou HW, Zhou YT, Mwange KN, Li WF, He XQ, Cui KM (2006) ABP1 expression regulated by IAA and ABA is associated with the cambium periodicity in Eucommia ulmoides Oliv. J Exp Bot 57: 3857-3867