有機質沉積物

湖泊中生長有大量植物、藻類和軟體動物，這些生物死亡後，堆積在湖底還原環境中分解，並和粘土淤泥一起組成含有機質沉積物。湖泊的還原環境可以是水體長期流動不暢引起，也可以是由季節性水溫變化引起，前者如長期處於窒息的湖泊(對石油生成有利)，後者如溫帶湖泊,兩者對有機物堆積都有重要影響。

溫帶湖泊一年四季水溫變化引起的水循環和水溫分層還原最明顯:春季(3月)湖水從凍結(低於4C) 向水溫增高變化，表層水密度變大(4C時水密度最大p=1.00g/cm2),與底部低溫、低密度水形成上下增溫對流,含氧水遍及湖區，還原環境，水溫分層利於生物生長，但生物殘骸很快氧化,不利有機質堆積。夏季(7月)湖泊表層水溫增高(大於4C),水密度變小，底部水溫較低、密度較大，從而出現水溫上下分層,使上下對流終止，底部處於缺氧狀態，引起生物死亡，並放出CO2和H2S,有利於有機質堆積(長期窒息湖泊情況與此相似)。秋季和冬季的水溫變化與分層分別相當於春季和夏季。熱帶和寒帶湖的水溫變化與分層現象不及溫帶湖明顯，熱帶湖泊多為缺氧環境，亞熱帶湖泊可能有冬季水溫分層。