張曦，博士，北京林業大學生物科學與技術學院副教授，碩士研究生導師。擔任Journal of Plant Physiology和Forestry research青年編委、北京大學南昌研究院特聘研究員、Plant Cell & Environment官方公眾號主編等。主要從事植物分子細胞生物學、樹木生命活動多模態跨尺度成像與分析以及樹木規模化繁育等前沿領域的研究。近年來在The Plant Cell、Plant Physiology、Trends in Plant Science、Science China-Life Sciences、Plant Cell and Evrionment、Genome Biology、Plant Methods、BMC Plant Biology等國際權威期刊發表學術論文40餘篇。主持國家自然科學基金、北京市自然科學基金、科技部重大專項子課題等多項國家級與省部級項目。授權國家發明專利6項，參編《植物細胞壁與木材形成》著作1部。致力於利用先進的成像技術解析植物發育的複雜機制。創新性地提出了植物多尺度網路連線的基本原則，整合了多尺度生物網路的理論框架與分析策略，並開發了多種植物三維重建技術與細胞網路分析方法。帶領團隊開展良種樹木規模化繁育項目，研製開發的“三元三步”與“二元—步”促根技術與產品，入選國家林草局2021年重要推薦成果，並在多地推廣套用，取得了顯著的生態與經濟效益。
基本介紹
人物經歷,研究方向,所獲榮譽,社會任職,承擔項目,發表論文,
人物經歷
2025.01-至今，北京林業大學，生物科學與技術學院，副教授
2021.07–2025.01，北京林業大學，生物科學與技術學院，講師
2018.04–2021.07，北京林業大學，生態與自然保護學院，博士後
研究方向
植物分子細胞與樹木發育學；樹木生命活動多模態跨尺度成像與分析；植物氮素攝取與根系形態建成；植物膜蛋白參與調控發育與逆境；樹木規模化繁育
所獲榮譽
國家林業和草原局重點推廣林草科技成果（2021年，成果名稱：樹木良種的“復幼-扦插”規模化繁育技術）
論文入選全球生物醫學領域權威同行評議資料庫Faculty Opinions，評分9.3（2021年，論文：Zhang et al., 2019, Science China-Life Sciences）
中關村NMT聯盟“非損傷微測技術套用貢獻獎”（2021年）
北京林業大學青年學術論文獎三等獎（2021年）
北京林業大學中央高校優秀青年團隊（2023年）
北京林業大學2023年教育教學改革與研究優秀論文獎一等獎、三等獎、優秀獎（2023年）
北京林業大學第二十屆青年教師教學基本功比賽三等獎（2024年）
社會任職
Journal of Plant Physiology、Forestry Research青年編委、北京大學南昌研究院特聘研究員、Plant Cell & Environment官方公眾號主編
承擔項目
（1）科技部農業生物育種重大項目子課題，抗松材線蟲病油松分子育種技術與新種質創製，70萬元，在研，主持
（2）北京市自然科學基金面上項目，基於多尺度三維重構與單細胞時空動態分析的銀杏種胚成熟機制研究，20萬元，在研，主持
（3）國家自然科學基金項目，基於多尺度三維重構與拓撲分析的種子休眠與發育調控機制研究，24萬元，結題，主持
（4）科技部農業生物育種重大項目，抗松材線蟲病高產油松新品種設計與培育，270萬元，在研，參與
（5）國家自然科學基金重點項目，磷酸化調控重要膜蛋白動態及其功能的機制研究，296萬元，在研，參與
（6）中央高校基本科研業務費專項資金，針葉樹重要性狀的遺傳調控解析與關鍵育種技術研發，240萬元，在研，參與
（7）中央高校基本科研業務費專項資金，基於多尺度三維重構與單細胞轉錄分析的銀杏種胚成熟機制研究，5萬元，在研，主持
（8）中國博士後科學基金面上項目，NRT1.1磷酸化修飾調控氣孔開閉的分子細胞學機制研究，8萬元，結題，主持
（9）國家自然科學基金項目，NRT1.1磷酸化修飾調控植物側根發育的分子細胞學機制研究，59萬元，結題，參與
（10）國家自然科學基金項目，擬南芥CJP1蛋白參與茉莉素調控的誘導型抗性的分子機理研究，26萬元，結題，參與
發表論文
1. Zijian Hu#, Jiazheng Liu#, Shiya Shen#, Weiqian Wu, Jingbin Yuan, Weiwei Shen, Lingyu Ma, Guangchao Wang, Shunyao Yang, Xiuping Xu, Yaning Cui, Zhenchen Li, Lijun Shen, Linlin Li, Jiahui Bian, Xi Zhang* (張曦), Hua Han*, Jinxing Lin*. Large-volume fully automated cell reconstruction generates a cell atlas of plant tissues, Plant Cell, 2024, 36(12), 4840–4861.封面論文
2. Lingyu Ma#, Zijian Hu#, Weiwei Shen, Yingying Zhang, Guangchao Wang, Bang Chang, Jinkai Lu, Yaning Cui, Huimin Xu, Yun Feng, Biao Jin, Xi Zhang* (張曦), Li Wang*, Jinxing Lin*. 3D reconstruction and multi-omics analysis reveal a unique pattern of embryogenesis in Ginkgo biloba. Plant physiology 2024, 196(1), 95–111. 封面論文
3. Xi Zhang# (張曦),Yaning Cui, Meng Yu, Bodan Su, Wei Gong, F Baluska, G Komis, J Samaj, Xiaoyi Shan*, Jinxing Lin*. Phosphorylation-mediated dynamics of nitrate transceptor NRT1.1 regulate auxin flux and nitrate signaling in lateral root growth. Plant Physiology. 2019, 181, 480–498.
4. Xi Zhang# (張曦),Yaning Cui, Meng Yu, Jinxing Lin*. Single-molecule techniques for imaging exo-endocytosis coupling in cells. Trends in Plant Science 2019, 24, 879–880.
5. Xi Zhang# (張曦),Yi Man#; Xiaohong ZhuangX#. Jinbo Shen#, Yi Zhang#, Yaning Cui et al. Plant multiscale networks: charting plant connectivity by multi-level analysis and imaging techniques. Science China-Life Sciences 2021, 64, 1392–1422.
6. Yaning Cui#, Xi Zhang# (張曦Co-first author), Meng Yu, Yingfang Zhu, Jingjing Xing, Jinxing Lin*. Techniques for detecting protein-protein interactions in living cells: principles, limitations, and recent progress. Science China-Life Sciences 2019, 62, 619–632.
7. Shiya Shen#, Yining Xie#, Zijian Hu#, Weiqian Wu, Yi Li, Weiwei Shen, Jie Wu, Yushuang Song, Xi Zhang* (張曦), Jinxing Lin*. Complete mitochondrial and chloroplast genomes of Haematoxylum campechianum L. reveal insights into gene transfer and RNA editing events. Industrial Crops and Products, 2025, 236, 122050.
8. Zijian Hu, Shiya Shen, Xi Zhang* (張曦). Unlocking the potential of the RUBY reporter system: How to address its challenges in plant‐environment interaction research? Plant, Cell & Environment, 2025, 48(7), 5250-5253.
9. Yuchen Kou#, Bodan Su#, Shunyao Yang, Wei Gong, Xi Zhang* (張曦) and Xiaoyi Shan*. Phosphorylation of Arabidopsis NRT1.1 regulates plant stomatal aperture and drought resistance in low nitrate condition. BMC Plant Biology, 2025, 25, 95.
10. Pingli Liu#, Xi Zhang# (張曦Co-first author), Jianfeng Mao, Yanming Hong, Rengang Zhang Shuai Nie et al. The Tetracentron genome provides insight into the early evolution of eudicots and the formation of vessel elements. Genome Biology. 2020, 21, 291.
11. Shaofeng Qu, Xi Zhang# (張曦Co-first author), Yutong Song, Jinxing Lin, Xiaoyi Shan*. THESEUS1 positively modulates plant defense responses against Botrytis cinerea through GUANINE EXCHANGE FACTOR4 signaling. Journal of Integrative Plant Biology 2017, 59, 797–804.
12. Xi Zhang# (張曦),ZijianHu, Yayu Guo, Xiaoyi Shan, Jinxing Lin*. High-efficiency procedure to characterize, segment, and quantify complex multicellularity in raw micrographs in plants. Plant Methods 2020, 16, 100.
13. Sammar Abbas, Ruotong Jing, Manzar Abbas, Zijian Hu, Rabia Kalsoom, Syed Sarfaraz Hussain, Liang Du, Jinxing Lin andXi Zhang* (張曦). Transcriptional profiling of BpWRKY49 reveals its role as a master regulator in stress signaling pathways in Birch (Betula platyphylla). Forests 2024, 15, 605.
14. Yanhui Yuan#, Yi Li#, Siying Liu a, Pichang Gong b, Jinxing Lin and Xi Zhang* (張曦). An overview of aptamer: Design strategy, prominent applications, and potential challenge in plants. Journal of Plant Physiology 2024, 296, 154235.
15. Yi Li#, Yanhui Yuan#, Zijian Hu, Siying Liu, Xi Zhang* (張曦).Genetic transformation of forest trees and its research advances in stress tolerance. Forests 2024, 15, 441.
16. Weiwei Shen, Chen Zhang, Guangchao Wang, Yujian Li, Xi Zhang (張曦), Yaning Cui, Zijian Hu, Shiya Shen, Xiuping Xu, Yuan Cao, Xiaojuan Li, Jialong Wen*, Jinxing Lin*. Variation pattern in the macromolecular (cellulose, hemicelluloses, lignin) composition of cell walls in Pinus tabulaeformis tree trunks at different ages as revealed using multiple techniques. International Journal of Biological Macromolecules. 2024, 268 131619.
17. Yujian Li†, Weiwei Shen†, Xi Zhang (張曦),Yaning, Yuanyuan Zhao, Yayu Guo, Xiaojuan Li, Shuizhong Wang, Guoyong Song, Pu Wang, Jianfeng Ma, Jinxing Lin*. Single-cell characterization of major components of plant cell walls in situ by Raman spectroscopy. Science China-Life Sciences 2024, 67(8), 1772–1774.
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