基因組文庫

基因組文庫

基因組文庫是指將某生物的全部基因組DNA切割成一定長度的DNA 片段克隆到某種載體上而形成的集合。基因組文庫根據DNA 來源又分為核基因組文庫、葉綠體基因組文庫及線粒體基因組文庫。基因組文庫構建時遺傳信息供體是基因組DNA,因而無發育時期及組織器官特異性,在一個完全的基因組文庫中包含著基因組DNA 上的所有編碼區及非編碼區序列的克隆; 生物有機體的每一個基因在文庫中都有其克隆,該克隆的基因片段里包括著間隔序列,所以基因組文庫可真實地顯示基因組的全部結構信息。

基因組文庫(Genomic Library)定義:把某種生物基因組的全部遺傳信息通過克隆載體貯存在一個受體菌克隆子群體中,這個群體即為這種生物的基因組文庫。

基本介紹

  • 中文名:基因組文庫
  • 外文名:genomic library
定義,文庫最小值,克隆載體,

定義

用限制性核酸內切酶切割細胞的整個DNA,可以得到大量的DNA片段,然後將這些DNA片段與載體連線,再轉移到細菌中去,讓宿主菌長成後進行克隆。這樣,每個克隆的細胞的載體上都包含有特定的基因組DNA片段,整個克隆群體就包含基因組的全部基因片段總和稱為基因組文庫。

文庫最小值

一個理想的基因組文庫要有足夠多的克隆子數,以保證所有的基因都在克隆子群體中。為了獲得某種基因需要構建的基因組文庫的最小值可按下面的經驗公式估算:
N=ln(1-P)/ln(1-f)
公式中,N表示基因組文庫必須的克隆子數;P表示文庫中目的基因出現的頻率,一般情況下,期望值為99%,即0.99;f是克隆的DNA片段平均大小與基因組大小的比值。

克隆載體

常見的用於構建基因組文庫的克隆載體有λ噬菌體克隆載體、cosmid克隆載體、BAC克隆載體、BIBAC克隆載體、PAC克隆載體和YAC克隆載體。

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