固是微生物群落

土壤是微生物的大本營，土壤中有習居菌，尤其在植物根部，不同的植物根部由於其含水、通氣及營養成分的不同，會有特定的微生物群落。包括水流、氣體、食材及其製品等，包括各種小環境，都有自己的固有微生物群落。

基本介紹

• 中文名：固有微生物群落
• 外文名：resident flora

各種小環境，都有自己的固有微生物群落。

皮膚微生物

皮膚微生物主要歸於放線菌門、硬壁菌門、擬桿菌門和變形菌門。然而放線菌門、硬壁菌門、擬桿菌門和變形菌門細菌的相對豐度與口腔和腸道中有著較大的差別，放線菌門在皮膚微生物中的相對豐度極高，而硬壁菌門和擬桿菌門則在腸道內的數量較高。皮膚微生物與腸道菌群有著共同特徵，即在門的水平下多樣性偏低，而在種的水平卻呈現出極高的多樣性。Grice等對人體手臂表皮的微生物群落做了16S rRNA基因測序，鑑別出113 OTUs（operational taxonomic units，運算分類單位），依據97%的相似性歸為6 個細菌主要門類，變形菌門為優勢菌群，並發現小鼠皮膚的菌群結構與人皮膚的菌群結構極為相似。

水稻微生物

雜交水稻（Oryza sativa L.）可分離細菌中變形桿菌為其優勢種群，假單胞菌和成團泛菌都是較優勢的種群。

土壤微生物

土壤微生物本身不僅是土壤養分的“源”和“庫”，支撐著土壤肥力；同時它也是土壤生態系統中極其重要和最為活躍的部分，是地上生態系統和地下生態系統的聯繫紐帶和橋樑：棕壤固有細菌群落中，最大菌群屬於變形菌門，其次是酸桿菌門，第三是厚壁菌門，第四是芽孢菌門,其中變形菌門以αα-變形菌綱為主,β-變形菌綱第二；固有真菌群落中，最大菌群屬於子囊菌門和接合菌門,其次為壺菌門與擔子菌門。