同源搜尋(homology search)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
基本介紹
- 中文名:同源搜尋
- 外文名:homology search
- 所屬學科:計算機科學技術
- 公布時間:2018年
- 屬性:計算機科學技術名詞

同源搜尋(homology search)是2018年公布的計算機科學技術名詞。
同源搜尋是2018年由全國科學技術名詞審定委員會公布的計算機科學技術領域基礎術語。該技術通過比對生物序列間的相似性推斷其演化關係,主要套用於基因組比對、蛋白質功能預測等生物信息學領域,其中diamond的'very'模式...
同源建模是通過比對目標蛋白與已知結構模板的序列相似性,構建三維結構模型的生物物理學方法。其核心流程包括模板搜尋、序列比對、骨架構建和側鏈最佳化等步驟,當目標與模板序列同源性超過30%時預測精度顯著提升。該方法在分子對接研究及冷凍電鏡數據補全等場景廣泛套用。隨著CASP競賽的推進,I-TASSER等工具持續最佳化模板比對...
BLAST程式有線上版亦有本地版。線上版可將輸入序列與龐大的已知來源序列信息庫進行比對,一般用於確定未知序列的來源,以及尋找不同物種中的同源基因;本地版是將輸入序列與本地自行構建的序列信息庫進行比對,比對的針對性更強,常用於在未發表基因組資料庫中尋找同源基因信息,不依賴於網路,安全性和可靠性更高。
“奇蹟”(Wonder)是俄羅斯搜尋引擎公司Yandex於2013年推出的可視化搜尋套用,支持語音及文本輸入,整合用戶Facebook好友的簽到記錄、照片和評價數據,提供本地地點查詢服務,並關聯Foursquare展示地圖詳情。其語音互動技術由美國Nuance公司授權,與蘋果Siri同源。該套用由Yandex駐美團隊開發,初期未獲莫斯科總部重點關注。上線...
青島同源基因科技有限責任公司成立於2015年7月27日,總部位於山東省青島市高新區秀園路1號科創慧谷(青島)科技園D-2-264室,註冊資本100萬元人民幣。公司專注於基因技術研發與服務,經營範圍涵蓋生物試劑銷售、基因診斷技術開發、計算機軟體及生物資料庫開發等領域。法定代表人王通自成立起即擔任執行董事兼總經理,
《漢藏語同源詞綜探》辭彙學書。韓國全廣鎮著。台灣學生書局1996年出版。全書共分“漢藏語同源詞研究史略”“漢藏語同源詞譜”“漢藏語同源詞的音韻對應”“漢藏語同源詞的詞義分類”等9章。在考察檢驗前人成果的基礎上,共選擇收錄了654對同源詞,利用漢語、藏語加以證明,此外還徵引緬甸語等其他親屬語言以為旁證...
《醫學同源》是清代徐延旭撰著的一部臨證綜合類中醫文獻,成書於清光緒五年(1879)。內容簡介 卷一介紹望色、問症、脈法、小兒驗紋等四診內容;卷二載述中風、虛勞、咳嗽、痢症、心腹痛、氣喘、血症、水腫、泄瀉、嘔吐、消渴、痰飲等三十一種病症,以及降逆、燥土、清金、疏木、升陷等十種治法,每一病症下均...
序列模體搜尋是一種查找系列上局部特徵的方法。對序列家族大量模體特徵的識別具有顯著優勢,並且可建立更具統計特徵的模體模型,從而提高序列分類的準確性。作用 該方法用於查找序列上的局部特徵.一般的,在序列整體同源性不明顯的情況下,該方法可以提高功能預測的靈敏度。組成 該方法一般由以下兩部分組成:(1)收集...
如果通過一個未知序列搜尋一個蛋白質序列資料庫,並且搜尋條件為序列等同程度小於25%的話,那么將會得到大量不相關的蛋白質。因此,搜尋遠程同源蛋白質就像在乾草堆里尋找一根針。尋找遠程同源蛋白質是一項困難的任務,處理這項任務的技術稱為“線索(THREADING)技術”。對於一個未知結構的蛋白質,僅當我們找不到等同...
RAD51蛋白核心功能區域為96-314位胺基酸,包含Walker A/Walker B核苷酸結合域構成的ATP酶活性位點。冷凍電鏡研究表明,其氨基末端結構域(NLD)通過L1/L2環特異性識別含雙鏈斷裂的核小體連線DNA,在修復起始階段起關鍵作用。當DNA損傷發生時,RAD51取代RPA蛋白結合單鏈DNA,形成螺旋核蛋白細絲催化同源搜尋和鏈交換。與...
EviMed搭載了全網七大知名中英文的醫學網站的同源文獻資料庫,構建了真正基於AI智慧型算法的醫學信息聚合搜尋引擎,並可自動探索信息關聯和理解,進行醫學大數據分析,最終實現全面準確的證據結論輸出。EviMed能夠基於任意給定的臨床問題,在實時更新中英文文獻、指南/共識、藥品說明書等循證證據中自動進行搜尋、篩選、分析和...
paronym 是英語中的一個名詞,其核心含義為“同源詞”,即在詞源或形式上與其他詞存在關聯的辭彙,例如派生詞或拼寫相近的詞。該詞源自希臘語"parōnumon",意為“通過輕微改變名稱形成的詞”。現代詞典普遍將其定義為具有相同詞根或形態相似性的辭彙,如'canal'與'cannalis'的派生關係。其形容詞形式為"paronymic"...
提問式構造方法的實質是利用同源詞、複合詞或n元匹配分析提問式中各個詞的權重:只有一種或兩種釋義的詞的權重最高,而有多種解釋的詞用同源詞符、複合詞符或n元匹配符連線以降低其權重。Pirkola等人通過對三種方法實驗,驗證了使用提問式構造法會提高跨語言檢索的檢索性能。文獻翻譯方法(document translation)文獻...
這種雙標記識別模式解釋了BRCA1-BARD1複合物在DSB位點特異性聚集的結構基礎。複合物形成後,通過募集PALB2等輔助因子形成修復支架,協調DNA末端切除與同源模板搜尋過程。腫瘤發生關聯 BRCA1基因突變導致:HR修復功能缺陷 基因組不穩定性增加 乳腺癌患病風險提升10-30倍 卵巢癌發病率上升15-40% PARP抑制劑通過"合成致死...
因此序列比對的結果並不能作為兩者之間一定存在同源關係的依據。常用序列比對程式通常給出一些統計值,用來表示結果的可信度。BLAST程式中使用的統計值由機率p和期望值e。機率p表示比對結果得到的分數值的可信度。一般來說,p越接近於0,則比對結果的可信度越大。期望值e描述搜尋某一特定資料庫時,隨機出現的匹配序列...
引物與非特異擴增區的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續8個鹼基在待擴增區以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。引物3‘端的鹼基,特別是最末及倒數第二個鹼基,應嚴格要求配對,最佳選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、螢光物質、地高辛標記,加入...
對預測出的基因進行高通量功能注釋可以藉助於以下方法,利用已知功能基因的注釋信息為新基因注釋: (1) 序列資料庫相似性搜尋; (2) 序列模體(Motif) 搜尋; (3) 直系同源序列聚類分析(Cluster of orthologousgroup ,COG) [2] 。隨著微生物全基因組序列測定速率的加快,開發有Web 接口的高效、綜合基因組注釋系統十分...
百度地圖底層一套數據、一套引擎,數據同源同宗,實現手車一體、艙駕一體;三大專屬圖層,路口圖層、實時圖層、經驗圖層,幫助智駕更安全、更像老司機。基礎服務 基礎服務 精準全面 AI化數據生產 在大模型時代,百度地圖 96% 數據加工環節已實現 AI 化,百度地圖還自研落地了行業首個地圖生成大模型,通過端到端車道...
同源建模(homology modeling)和指認(Threading)方法屬於這一範疇。同源建模用於尋找具有高度相似性的蛋白質結構(超過30%胺基酸相同),後者則用於比較進化族中不同的蛋白質結構。然而,蛋白結構預測研究現狀還遠遠不能滿足實際需要。基因識別分析 基因識別的基本問題是給定基因組序列後,正確識別基因的範圍和在基因組...
caballero是英語中的名詞,源自拉丁語"caballus",與"cavalier"同源。該詞主要有兩個核心含義:1. 西班牙語中的紳士或騎士;2. 擅長騎馬和管理馬匹的人。在美國西南部地區,該詞也被用來指代女性護送者或陪伴者。其複數形式為"caballeros",被納入專業四級大綱核心辭彙和經濟學人詞頻表。常見同義詞包括"gentleman"、...
傳說苗族古代曾有文字,與漢字可能同源,後來失傳,這些傳說如今已難以考證。20世紀初,一些苗族知識分子為發展苗族文化教育,創製了一些方言文字,如湘西石板塘創製的方塊苗文、石啟貴創製的速記苗文,貴州松桃龍紹華運用國際音標編制的苗文課本等等。一些外國傳教士為了傳教的需要也創製了一些苗文。但是這些苗文因種種條件的限制...
王力《漢語語音史》、《同源字典》均為三十三個,多一個“俟”母。山母亦寫作“生”。 聲母亦稱“紐”。同紐為雙聲。同類同直行,或舌齒同直行者為準雙聲。同類同橫行者為旁紐。同類不同橫行者為準旁紐。喉與牙、舌與齒為鄰紐。 考究 播報 編輯 中國漢語音韻學術語。音韻學家用來指稱漢字聲母的代表字。字母...
查一般語詞/175查成語、熟語/176查行話、隱語/178查方言詞/179查外來詞/180查虛詞/181查聯綿詞/182查同源詞/182查同義或反義詞/183查類別詞/184查各種文學體裁中的詞/185查一代、一書或一人著作中的詞/187 第三節 查專名、術語/190 文史綜合類/192文學類/192語言學類/198史學類/201哲學、宗教類/203 思考...
全書系統梳理同源建模、摺疊模式識別、分子對接等核心方法,涵蓋二級結構預測、蛋白質-複合物模擬及分子動力學計算等實操流程。通過SWISS-MODEL、Discovery Studio等軟體實例演示參考蛋白搜尋、序列比對及模型構建等關鍵技術。附錄收錄相關網路資源供實驗者擴展工具選擇與數據獲取。書中所述方法被套用於G蛋白偶聯受體結構解析及...
"協力齊心"是聯合式結構的漢語成語,拼音為xié lì qí xīn,釋義為思想一致、共同奮鬥。該成語最早可追溯至漢朝賈誼《過秦論》"且天下嘗同心併力攻秦矣"的表述,後世亦有清代林則徐奏摺中使用實例。語法上可作謂語、定語或狀語使用,近義詞包括"協心同力""齊心協力",反義詞為"貌合神離"。在語義演變中形成同源...
中國自古就有“書畫同源”一說,這是因為最早的文字來源就是圖畫,書與畫好比是兄弟,同根生,有很多內在的聯繫。漢字的起源就是原始的圖畫,原始人在生活中用來表達自己的“圖畫”形式。慢慢的從原始圖畫變成了一種“表意符號”。賈湖刻符 八千多年前的河南舞陽賈湖遺址(距今9000—7800年),出土了一批刻符,...
烏克蘭人和俄羅斯人,同根同源,都是東斯拉夫人,因為蒙古人以及波蘭、立陶宛人的入侵,大部分烏克蘭人逐漸遵奉梵蒂岡教廷為正宗,而俄羅斯人則信奉東正教,以東羅馬帝國的正統繼承者自居。1648年,赫梅利尼茨基領導的哥薩克在烏克蘭舉行民族起義,當時烏克蘭的統治階級內部分崩離析。1654年,赫梅利尼茨基與俄羅斯沙皇簽訂《佩列亞斯拉...
這一時期秦國只能專心經營西戎、不敢輕舉妄動(詳見詞條晉秦爭霸戰爭), 齊國則在挑戰晉國霸權的戰爭中被打得一敗塗地(詳見詞條鞌之戰),楚國則被晉國逐步壓制不能與之爭鋒。故而,史家認為:在春秋時代的大部分時間當中,所謂霸業者都是靠晉國來維持,是同根同源同宗的周王室名符其實的有力拱衛者。
