反向重複序列

反向重複序列指兩個序列相同的拷貝在DNA鏈上呈反向排列, 是DNA重複序列的一種類型。反向重複序列散布在整個基因組中,約占人類基因組中占5%,常見於基因的調控區,可能與基因的轉錄、複製有關。反向重複序列的一種形式是反向排列的兩個拷貝間隔著一段序列,另一種 形式是兩個拷貝之間沒有間隔序列,呈反向串聯,這種結構又稱回文式序列。

基本介紹

  • 中文名:反向重複序列
  • 外文名:inverted repeat sequence
  • 類型:專有名詞
  • 領域:生物基因
  • x學科標籤:分子生物學
反向重複序列 (inverted repeat sequence):
反向重複序列
如圖一GTGCTAA和TTAGCAC構成反向重複序列。在雙鏈DNA中反向重複可能引起十字形結構的形成。(圖一上面的序列為反向重複序列,同時,注意到它兩條鏈順讀是一樣的,且中間沒有間隔序列,因此它是迴文序列;圖一下面的序列為鏡像重複序列。詳情參見下文辨析。)
迴文結構(palindromic structure):
在真核細胞染色質DNA分子中,還存在大量特殊的序列,這種結構中脫氧核苷酸的排列在DNA兩條鏈中順讀與倒讀其意義是一樣的,脫氧核苷酸的排列
對於一個假象的軸成180°旋轉對稱,這種結構稱為迴文結構。
幾種重複序列辨析非正式名詞解釋):
反向重複序列
(Inverted repeat sequence)
5'AAAANNNNTTTT3'
3'TTTTNNNNAAAA5'
兩條鏈中以5'->3'方向讀出來是一樣的,兩條鏈旋轉對稱。
迴文序列
(Palindromic sequence)
5'AAAATTTT3'
3'TTTTAAAA5'
當反向重複序列中沒有“NNNN”時就稱為迴文序列,兩條鏈旋轉對稱。
正向重讀序列
(Direct repeats sequence)
5'ATCGNNNNATCG3'
3'TAGCNNNNTAGC5'
在同一條序列中有重複(NNNN的前後序列都是AAAA),中間的NNNN可有可無。
鏡像重複序列
(Mirror repeats)
5'ATCGNNNNGCTA3'
3'TAGCNNNNCGAT5'
兩條鏈都呈軸對稱。

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