《分子考古學導論》是2008年科學出版社出版的圖書，作者是蔡大偉。這本書最大的亮點在於它是我國分子考古領域第一部基礎性讀物，書中系統介紹了分子考古學基本概念、理論原理、研究方法以及國內外的主要研究方向和進展。
基本介紹
- 書名：分子考古學導論
- 作者：蔡大偉
- ISBN：9787030234049
- 頁數：249頁
- 出版社：科學出版社
- 出版時間：2008-12-1
- 裝幀：平裝
圖書信息,作者簡介,內容簡介,目錄,
圖書信息
出版社: 科學出版社; 第1版 (2008年12月1日)
正文語種: 簡體中文
開本: 16
條形碼: 9787030234049
尺寸: 23.4 x 16.8 x 1.4 cm
重量: 458 g
作者簡介
蔡大偉，1969年11月出生於長春。2007年畢業於吉林大學生命科學學院，獲理學博士學位，於當年留在吉林大學邊疆考古研究中心任教，主講“分子考古學”課程，現為吉林大學歷史學博士後流動站博士後，多年來一直從事分子考古研究，參與多個國家級重大項目的研究工作，先後發表文章十餘篇，其中在SCI收錄的刊物上發表論文5篇，近期的主要研究方向是中國古代家養動物的起源研究，先後對中國多個遺址出土的綿羊和馬遺骸進行了古DNA分析，從分子水平上揭示了中國綿羊以及家馬的起源，為探索古代社會的經濟結構以及人群的遷徙提供了分子生物學證據。
內容簡介
《分子考古學導論》是我國分子考占領域的第一部基礎性讀物，它系統地介紹了分子考古學的基本概念、理論原理、研究方法以及國內外的主要研究方向和進展。《分子考古學導論》適合作為考古學、博物館學本科生、研究生的必修課教材，同時，也可以作為分子進化和古生物專業研究人員的參考書。
目錄
前言
緒論
一、什麼是分子考古學？
二、分子考古的主要研究內容
1.研究人類的起源與遷徙
2.古代動植物的馴化
3.古人的個體識別、群體遺傳關係及族屬鑑定
4.古人與生活環境的關係
5.古病理研究
三、分子考古學理論基礎與研究方法
四、什麼是古DNA，有何特點？
五、古DNA分子保存年限
六、古代DNA研究的歷史與現狀
第一篇 生物學基礎
第1章 生物大分子
1.1 蛋白質
1.1.1 肽鍵
1.1.2 蛋白質的結構與功能
1.1.3 同源蛋白質
1.2 核酸
1.2.1 鹼基、核苷、核苷酸
1.2.2 核酸的紫外吸收
1.2.3 核酸的變性、復性與雜交
第2章 基因與基因組
2.1 基因的定義
2.2 基因組定義
2.3 半保留半不連續複製機制
2.4 基因的突變、損傷與修復
2.5 基因重組
2.6 基因轉錄
2.7 遺傳密碼
2.8 蛋白質的生物合成
第3章 基因組演化與物種分類
3.1 細胞的形成
3.2 從單細胞生物到多細胞生物
3.3 病毒基因組
3.4 原核生物染色體結構
3.5 真核生物的染色體結構
3.6 人類基因組
3.7 基因組進化模式
3.8 物種的分類
3.9 分子系統樹
第4章 遺傳多態性標記
4.1 遺傳多態性標記的分類
4.1.1 形態、生理標記
4.1.2 染色體標記
4.1.3 血型和蛋白質標記
4.1.4 DNA標記
4.2 DNA多態性研究
4.2.1 DNA多態性形成機制
4.2.2 DNA標記的分類
4.2.3 人類DNA多態性研究的歷史和現狀-
4.3 mtDNA遺傳多態性標記
4.3.1 mtDNA遺傳系統的特點
4.3.2 mtDNA多態性檢測方法
4.3.3 mtDNA多態性研究在人類進化上的套用
4.3.3.1 非洲人群的遷移和mtDNA變異
4.3.3.2 歐洲人群的遷移和mtDNA變異
4.3.3.3 亞洲人群的遷移和mtDNA變異
4.4 Y染色體遺傳標記
4.4.1 Y染色體結構
4.4.2 Y染色體遺傳系統的特點
4.4.3 Y染色體變異形式
4.4.4 Y染色體多態性檢測方法
4.4.5 單核苷酸多態位點變異在人類進化中的套用
第二篇 古DNA套用實例
第5章 人類古DNA研究套用
5.1 古DNA在人類起源研究中的套用
5.2 古DNA在人群水平上的套用
5.2.1 歐洲人群研究
5.2.2 新疆地區人群研究
5.2.3 中國北方地區古代人群研究
5.3 古DNA在家庭或家族水平的套用
5.4 古DNA在個體水平的套用
5.4.1 性別鑑定
5.4.2 個體身份識別
5.5 古DNA在古病理學的套用
第6章 古DNA與家養動物起源研究
6.1 家養動物起源研究的研究方法
6.1.1 考古調查
6.1.2 分子生物學分析
6.2 家豬的起源研究
6.3 狗的起源研究
6.4 黃牛的起源研究
6.5 綿羊的起源研究
6.6 山羊的起源研究
6.7 家馬的起源研究
第7章 植物古DNA研究套用
7.1 小麥古DNA研究套用
7.2 玉米古DNA研究套用
7.3 稻古DNA研究套用
7.4 高粱古DNA研究套用
7.5 其他植物遺存古：DNA研究套用
7.6 植物化石古DNA研究套用
7.7 冰芯中植物古DNA研究套用
第三篇 古DNA的研究方法
第8章 古DNA研究流程
8.1 古DNA實驗技術流程
8.1.1 考古發掘人員樣本採集
8.1.2 樣本評估
8.1.3 樣本處理
8.1.4 DNA提取
8.1.5 PCR擴增
8.1.5.1 PCR技術的基本原理
8.1.5.2 PCR反應5要素
8.1.5.3 PCR系統中的其他成分
8.1.5.4 PCR反應參數
8.1.6 PCR產物檢測
8.1.7 PCR產物純化
8.1.8 測序
8.2 古DNA序列的真實性
8.2.1 污染來源
8.2.2 污染的控制
8.2.3 污染的識別
8.2.4 甄別古DNA的標準
8.3 古DNA研究中的新進展
8.3.1 螢光實時定量PCR
8.3.2 擴增產物長度多態性
8.3.3 嘧啶N糖基化酶
8.3.4 焦磷酸測序技術
8.3.5 多重PCR
第9章 古DNA數據分析
9.1 系統發育分析
9.1.1 系統發育樹
9.1.2 序列比對與排序
9.1.3 系統發育樹的重建
9.1.3.1 距離法
9.1.3.2 簡約法
9.1.3.3 似然法
9.1.3.4 進化樹搜尋
9.1.3.5 系統樹樹根的確定
9.1.3.6 其他構樹方法
9.1.3.7 不同構樹方法的評估和比較
9.1.3.8 系統發育樹的檢驗
9.2 遺傳多維尺度分析
9.3 主成分分析
9.4 群體遺傳學分析
9.4.1 群體遺傳多樣性指度分析
9.4.2 核苷酸配對差異分析與中性檢驗
9.4.3 分子差異分析
9.4.4 基因混合度計算
第10章 古DNA研究常用軟體
10.1 引物設計
10.1.1 引物設計原則
10.1.2 PrimerPremier軟體
10.2 從測序圖譜到DNA序列——Chromas軟體的套用
10.2.1 檔案輸入及導出
10.2.2 圖譜的編輯及序列查找
10.3 序列檢索
10.3.1 相似性檢索
10.3.2 相關序列的下載
10.4 DNA序列的比對及排序——Clustal軟體的套用
10.4.1 序列輸入
10.4.2 編輯比對序列
10.4.3 多重序列比對
10.4.4 構建系統樹
10.5 分子系統樹的構建及檢驗與Phylip軟體包的使用
10.5.1 Phylip軟體包輸入數據的格式
10.5.2 用Phylip軟體包構建系統發育樹
10.6 Mega軟體包在分子系統學中的套用
10.6.1 Mega數據的輸入
10.6.2 數據檔案的導人
10.6.3 序列特殊信息的瀏覽和輸出
10.6.4 序列的分組
10.6.5 序列的組成成分統計
10.6.6 遺傳距離的計算
10.6.7 系統發育樹的構建及檢驗
10.6.8 多重序列比對
10.7 Arlequin軟體包在分子系統學中的套用
10.7.1 Arlequin軟體包輸入數據的格式
10.7.2 Arlequin軟體包操作界面簡介及數據輸入
10.7.3 遺傳多樣度指數選單
10.7.4 中性檢驗選單
10.7.5 遺傳結構分析選單
10.8 Network軟體與中介網路圖的構建
10.8.1 Network軟體輸入數據及其格式
10.8.2 中介網路圖的構建
10.8.3 繪製中介網路圖
10.8.4 Network軟體操作技巧
10.9 SPSS軟體與遺傳多維尺度分析及主成分分析
10.9.1 SPSS數據輸入
10.9.2 SPSS與遺傳多維尺度分析
10.9.3 SPSS與主成分分析
