冷泉港蛋白質組學實驗手冊

冷泉港蛋白質組學實驗手冊

《冷泉港蛋白質組學實驗手冊》在2012年出版。

基本介紹

  • ISBN:9787122141217
  • 頁數:194
  • 定價:68.00元
  • 出版時間:2012-9
  • 副標題:冷泉港蛋白質組學實驗手冊
內容簡介,目錄信息,

內容簡介

《冷泉港蛋白質組學實驗手冊》為美國冷泉港實驗室蛋白質組學課程培訓用書,為蛋白質組學工作者案頭必備實驗手冊。 內容涉及各種蛋白質製備和分離方法、質譜分析的一般方法、用於蛋白質表達的編碼序列的高通量克隆、蛋白質晶片的製備和使用以及驗證這些數據的分析方法等內容。書中附有大量的以step-by-step形式展現的操作程式,針對關鍵性步驟增加說明性文字加以點撥,並有信息框闡述關鍵的知識點,具有很強的實用性和可操作性。

目錄信息

1實驗1全細胞裂解物的雙向凝膠電泳和MALDI 質譜分析11
操作程式11酵母細胞裂解液的製備15
操作程式12IPG膠條的再水化和等電聚焦16
操作程式13等電聚焦膠條的平衡20
操作程式14第二向——SDSPAGE21
操作程式15用SYPRO Ruby進行全蛋白染色23
操作程式16用ProQ Diamond進行磷酸化蛋白染色24
操作程式17用ProQ Emerald進行糖蛋白染色24
操作程式18用考馬斯亮藍進行全蛋白染色25
操作程式19用質譜兼容的銀染進行全蛋白染色26
操作程式1102D膠的圖像分析和蛋白質回收26
操作程式111膠內酶切28
操作程式112MALDI點靶29實驗2用於質譜分析的蛋白質複合物的純化32
操作程式21培養並收集TAP標記的酵母細胞33
操作程式22為純化TAP標記蛋白質複合物製備酵母細胞抽提物35
操作程式23第一步親和富集——利用IgG親和色譜從酵母抽提物中捕獲TAP標記的蛋白質複合物37
操作程式24第二步親和富集——TAP標記的蛋白質複合物的鈣調蛋白親和色譜40
操作程式25與磁珠的結合42
操作程式26蛋白質複合物的親和純化45實驗3用MALDI TOF/TOF串聯質譜進行肽的定性和定量分析49
操作程式31實驗描述50實驗4蛋白質複合物分析——高靈敏液相色譜與串聯質譜聯用60
操作程式41HPLC柱毛細管的製作61
操作程式42填裝微毛細管FSC柱64
操作程式43微毛細管RPHPLC與ESI質譜聯用67實驗5用IMAC和質譜分析磷酸化肽72
操作程式51製備IMAC樣品73
操作程式52製備IMAC柱和反相捕獲柱(前柱)75
操作程式53製備IMAC柱76
操作程式54樣品處理77實驗6全細胞裂解物的多維蛋白質鑑定技術分析81
操作程式61使用多維蛋白質鑑定技術分析全細胞裂解物83實驗7全細胞提取物的定量質譜檢測技術(iTRAQ)88
操作程式71從酵母細胞製備肽91
操作程式72以iTRAQ試劑標記肽93
操作程式73套用反向色譜柱提純肽94
操作程式74多肽等電聚焦95實驗8串聯質譜數據的分析及確認100
操作程式81使用Global Proteome Machine系統分析LCMS/MS數據104
操作程式82使用ProteinPilot軟體進行肽段和蛋白質鑑定112
操作程式83對資料庫檢索程式鑑定為能夠匹配肽段序列的MS/MS譜圖
進行評價118實驗9開放閱讀框的高通量克隆——構建大量表達結構125
操作程式91利用Gateway LR反應構造表達結構129
操作程式92用Gateway LR反應產物化學轉化感受態細菌130實驗10蛋白質微陣列的構建——核酸可程式性蛋白質陣列134
操作程式101用氨基甲矽烷包被載玻片139
操作程式102在96孔板中製備細菌的培養物139
操作程式103從96孔板中分離質粒DNA142
操作程式104DNA的生物素化、沉澱及樣品布陣145
操作程式105NAPPA載玻片上蛋白質的表達147
操作程式106檢測NAPPA載玻片上的蛋白質149
操作程式107在NAPPA晶片上測定DNA151實驗11使用核酸可程式性蛋白質陣列鑑定蛋白質蛋白質相互作用153
操作程式111NAPPA晶片與查詢蛋白共表達154
操作程式112在NAPPA晶片上檢測查詢蛋白156
附錄1鈉升電噴霧電離離子源和串聯質譜裝置和示範159
附錄2溶液內蛋白質的消化164
附錄3凝膠內胰酶消化已分離蛋白167
附錄4三氯乙酸蛋白質沉澱法170
附錄5胺基酸的單同位素和亞銨離子分子量171
附錄6胺基酸二肽分子量172
附錄7LTQ離子阱的使用方法173
附錄8肽段混合物離線去鹽180
附錄9感受態細胞的製備183
附錄10DNA的定量185
附錄11注意事項186
索引193

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