嘉慶九年（1804），補授為溫州千總。次年代理黃岩守備。當時海盜蔡牽作亂，起蛟跟隨提督李長庚去福建征剿。蔡牽正進犯台灣，將船沉在鹿耳門來抵拒官軍。起蛟同眾位將士努力奮戰。蔡牽奪路逃遁，並勾結廣東盜賊朱濆進入古鎮洋。起蛟追擊於泉州張坑洋，又擊之於金門返埕洋，斬首七十三級，殲滅盜首陳熕，繳獲盜船三十二艘。接著又追擊海盜於定海漁山，追到披山外洋，奪船三艘，斬首三十級，俘獲盜首陳角、劉永、郭英等及余盜 九十七人。這一年，蔡牽被消滅。起蛟調署浙江玉環任守備。當年發生嚴重饑荒，大群饑民圍住廳署，要求賑濟。玉環同知請求動用兵卒彈壓。起蛟不同意，認為這樣做只能激化群情，引起更大動亂。於是單人獨騎去撫慰勸退饑民。同時與同知等商議如何幫助民眾渡荒，事遂安定。嘉慶十七年（1812），調任溫州游擊，二十四年（（1819）升任江南吳淞參將，不久調到川沙，又不久升任京口副將。道光元年（1821）署理壽春鎮總兵，十二月，實授福建海壇鎮總兵。曾考慮驅捕海盜時有誣指良民為盜之事，特報請總督嚴令各州縣，在入海商船船篷上用大字寫上郡縣姓名，以免誤指。從此，海盜無法混跡，而士兵也不敢指商船漁船為盜船。起蛟功業有成，在家鄉建造大宅院，並在大廳甬道石板下埋下寶劍“鎮宅”。卒年五十八歲。
