DNA 條形碼技術是近年來發展起來的一種新的物種識別方法。簡單地說，DNA 條形碼是基於這樣一個前提，即基因組中一個不顯著偏長的標準化的DNA 序列片段能夠提供足夠多的信息來達到在物種水平上識別眾多分類單元的目的。近來的研究顯示，利用線粒體細胞色素C氧化酶亞基I (COI ) 基因5’端的一段長度為648bp 的序列變異能夠為不同動物門類中關係密切的物種類群提供一種快速而且可信的識別方法。因此，目前普遍認為線粒體COI 基因將是為動物物種編制DNA 條形碼的一個好的候選標記。我們通過選擇線粒體COI 基因序列片段作為標記，構建中國淡水魚類的DNA 條形碼資料庫，並將建立的DNA條形碼資料庫與目前運行的中國魚類生物多樣性資料庫整合，從而建立中國淡水魚類物種和對應的DNA 條形碼相連結的綜合資料庫。目前，中國淡水魚類DNA 條形碼資料庫與超級計算環境結合，用戶提交一段魚類線粒體COI 基因序列，通過與資料庫中的序列比對，返回比對結果，若得到相似性非常高的序列可以，則可鑑別該淡水魚的物種。DNA 條形碼資料庫包括FishBOL 中已公開發表的魚類和中國科學院水生生物研究所已測定魚類DNA 條形碼序列。
基本介紹
- 中文名：中國淡水魚類物種鑑別專業資料庫
- 外文名：Identification of freshwater fish species China professional database
- 國家：中國
- 技術：DNA 條形碼技術
內容簡介,使用方法,套用案例,持續發展,
內容簡介
FishBOL 已公開發表的魚類包括12375 個標本，屬於2430 個魚類物種，中國科學院水生生物研究所已測定的魚類標本大約有5000 個，屬於300 個魚類物種，並且數據還在不斷增加過程中。
使用方法
本系統數據檢索方法簡單易用，系統提供了中國淡水魚類物種樹形查詢和生物分類階元文字查詢兩種方式。通過查詢可以獲得魚類生物多樣性等各項信息及DNA 條形碼序列。通過提交一段魚類線粒體COI 基因序列，系統可以返回與DNA 條形碼資料庫比對的結果，鑑別物種信息；或者提交魚類組織，可以為用戶提供鑑別物種幫助。
用戶在需要的數據量較大或者不方便通過本系統網站直接查詢和下載數據時，可以使用本系統提供的“數據委託查詢”服務和“數據傳遞通道”服務。用戶可通過線上填寫或者離線填寫後傳送郵件的方式，將委託查詢需求提交給本系統的數據服務人員，由數據服務人員為之搜尋及加工整理所需要的數據。用戶需要使用數據傳遞服務時，可向本系統的數據服務人員說明需要傳遞哪些數據，數據服務人員將根據用戶的實際情況為之開通某種特殊的數據傳遞通道（FTP、硬碟直接拷貝或光碟郵寄），以方便其獲得所需數據。
套用案例
本系統自開通服務以來，已經為數千位來自科研機構、高校、政府部門、企業等的用戶提供了數據服務，支持這些用戶的科研、工程或決策工作。例如：
1. 麥德龍（武漢）公司：利用本系統鑑別真假鱈魚，麥德龍（武漢）公司提供的樣本最終鑑別結果為鱈形目，鼠尾鱈科，突吻鱈屬，粗鱗突吻鱈，分布在被太平洋、日本北方、墨西哥北部，是真的鱈魚。假的鱈魚俗名“油魚”，屬於鱸形目。
2. 湖北省水產局：利用本系統幫助湖北省水產局鑑別多種珍稀特有魚類。
持續發展
本系統將不斷更新並增加已發表的全球魚類DNA 條形碼數據及中國國內魚類DNA 條形碼數據。
