中國數字植物標本館

中國數字植物標本館

中國數字植物標本館(英語:Chinese Virtual Herbarium,簡稱CVH)是一個中國植物標本及相關植物學信息的網站,由中華人民共和國科學技術部國家科技基礎條件平台”項目資助,中國科學院植物研究所主持,參與建設單位(共建單位/成員單位)達20餘家。

基本介紹

  • 中文名:中國數字植物標本館
  • 外文名:Chinese Virtual Herbarium
  • 建設單位中國科學院植物研究所
  • 作用:提供中國植物標本
  • 目標:數位化中國1600多萬號標本
  • 標本館代碼:PE
  • 建館時間:1928年
  • 標本數量:2650000
  • 城市:北京
簡介,辦館目的,建設發展,資料庫,中國植物標本館索引,

簡介

中國數字植物標本館是由中國科學院生物標本館,植物研究所,昆明植物所,華南植物園,版納熱帶植物園,瀋陽套用生態所,武漢植物園,西北高原生物所,成都生物所,新疆生地所,西北農林科技大學,廣西植物所,江蘇省植物所,廬山植物園,四川大學,中山大學,南京大學,南開大學,武漢大學,內蒙古大學,廣西中醫藥研究所等共同創建。
“中國數字植物標本館是在科技部“國家科技基礎條件平台”項目資助下建立的,其宗旨是為用戶提供一個方便快捷獲取中國植物標本及相關植物學信息的電子網路平台;中國科學院及其他部委(局)也為網站建設提供相關支持。
標本量
中國科學院植物研究所所長馬克平介紹,數字植物標本館分為4部分:數位化標本庫、植物資料庫、電子植物志、植物圖片庫。數位化標本庫目前收錄有200多萬號一般標本和3000號模式標本。植物資料庫提供中國植物名錄、植物文獻資料庫、中國乾燥標本集等多項查詢。電子植物志包括中國植物志、西藏植物志、青海植物志、秦嶺植物志、四川植物志、海南植物志等。網站還上載了240科、1469屬、3784種,總計27300張植物彩色照片。標本館還設有主要國際乾燥標本集以及相關數據的搜尋引擎。

辦館目的

中國數字植物標本館建設的目的包括:1. 提供中國植物標本及相關植物學的全面和最新的信息,供專家及一般用戶上網查詢;2. 為國內同行間交流與合作提供平台,並實現與國際接軌;3.提供政府及民間對植物多樣性保護和可持續利用的參考資料;4.促進參與標本館的現代化管理建設進程。最終目標是把CVH建設成為中國植物標本信息及植物學科的國家型入口網站。
“中國數字植物標本館”網站自二零零六年初開通以來,訪問量(點擊率)累計超過二百萬次,近期平均點擊率達到每天4.4萬次、6000人。CVH已經成為國內外同行認知度越來越高的專業網站。
目前CVH網站包含資料庫20餘個,數據量達3.3TB。參與建設單位(共建單位/成員單位)達20餘家,包括中國科學院和地方科學院及一些大學標本館,基本上包含了我國主要和重要的標本館。

建設發展

中國的生物多樣性豐富,據《中國植物志》記載,中國擁有3萬多個物種,52%為中國特有。中國科學院聯合國內其他研究機構建立了中國數字植物標本館。數字植物標本館自2004年開始建設,以20世紀的主要標本數據為基礎,2006年9月在網路上推出第二版,第三版正在進一步開發中。
中國數字植物標本館
中國數字植物標本館還通過和英、美等國家相關機構的合作,完善標本館的數據建設和更新。馬克平說,中國數字植物標本館是國內自主開發、建設起來的,但在模式標本、植物學文獻庫以及世界植物志方面需要和國外進行合作。這些合作一方面實現世界植物研究方面的資源共享,另一方面使中國數字植物標本館一開始就能夠和國際研究接軌。
今年,中國數字植物標本館計畫收集100多萬號一般標本和8000多號模式標本。標本館的最終目標是將中國已有的1600多萬號標本全部數位化。

資料庫

1.標本信息
提供成員單位標本館所完成的數位化標本信息,包括一般標本及模式標本。每份標本信息包括標籤信息及圖像信息,前者包括標本採集人、採集日期、地點、生境與海拔以及鑑定信息和標本存放地點(標本館)等。
目前在CVH網上能查詢到中科院系統13家標本館標本,總計二百八十五萬份(筆)標本信息及一百五十五萬張標本圖像,缺乏圖像的記錄已在首頁予以標明。
網上模式標本6500份,僅包括中科院植物所標本館館藏的模式標本,包括裸子植物、毛茛科、蕁麻科、山茶科、殼斗科等類群。信息均經過核實,還附有發表新種的原始文獻(PDF格式)以及高解析度標本圖像。
分散式標本信息檢索系統:目前CVH的標本信息是通過集中式實現共享查詢的,其主要缺陷是更新周期長,存儲壓力大。我們正在試驗的分散式標本信息查詢系統已有5家標本館(稱CVH分館)參與,共有100多萬份標本信息實現實時更新,並由成員單位通過FTP自主管理其分館,有效地發揮成員單位的積極性。
2.《中國植物志》資料庫
包括全套《中國植物志》79卷(除第一卷外)125冊圖書的PDF檔案,可通過科名和植物名稱(學名、中名)查詢到志書文字及圖版。最近完成的檢索檔案覆核補充工作使資料庫更全面準確地反映植物志的內容,除正名(accepted name)外,討論部分的學名也可查到。資料庫記錄數:45000餘條。
3.彩色圖庫
上傳到CVH網站上的植物彩色照片總計五萬餘張,屬於269科5700種,為近年來眾多志願者自野外拍攝所得,範圍涉及在全國34個省(區、市)的野生植物。下階段將逐步建立彩圖鑑定專家系統,以提高照片鑑定準確性。
銀杏 Ginkgo biloba銀杏 Ginkgo biloba
至此,用戶輸入學名或中名可關聯性查詢到標本、植物志及彩色圖片三大資料庫,這也是CVH的主要資料庫。
4.其他相關資料庫
為方便用戶使用標本信息,“中國數字植物標本館”網站還提供其他大量相關的(植物學)資料庫,如標本採集地名與標本館數據、分類研究人員及其研究論文題錄等。這些資料庫或源自實際工作經驗的總結、或直接轉自權威工具書並經過專家審核。
1)《中國高等植物圖鑑》資料庫
為該書全套五冊正編及兩冊補編共7本書的全文檢索。可通過科名和植物名稱(學名及中名)查詢到書中正文文字及圖畫。資料庫記錄數:9057條。
2)地方植物志及其統一查詢
提供12套地方志的數位化文擋(PDF檔案),可通過統一關聯查詢任何1-12種植物志信息,包括西藏、秦嶺、遼寧、貴州、浙江、海南等省(區/市)及地區植物志。下階段計畫實現《中國植物志》與地方植物志的關聯查詢。資料庫記錄數:47112條。
3) “三種主要志書屬名資料庫”
提供查詢中國維管植物屬名在《中國植物志》、《中國高等植物圖鑑》和FLORA OF CHINA中的位子,包括卷冊及頁碼。這三套志書(圖鑑)是目前研究中國植物的主要參考書。該資料庫的覆核工作已於最近完成,增加了新近出版 FLORA OF CHINA卷冊內容,並修改(修訂)數百條記錄,使數據更準確全面。資料庫記錄數:3504條。
4)植物名稱及分布資料庫
通過該庫可以快速查詢到中國種子植物名稱及分布信息(到省級)等簡單信息。資料主要來源於《中國植物志》和 已出版的Flora of China,可以認為是《中國植物志》的名錄修訂。目前資料庫記錄數:34056條。
5)模式標本名錄及其原始文獻資料庫
該資料庫以收集中國原生植物(Native plant)名稱模式標本及其發表原始文獻資料為宗旨,無論其模式標本採集地及保藏地在國內或國外、該名稱何時於何種刊物發表都儘量予以收錄。每條記錄包括植物名稱(學名、中名)、發表刊物,模式標本採集地點和生境、年代及標本採集人和採集號,以及標本存放地點(標本館)。大部分資料以外文形式出現。資料庫資料來源於國內外多種書刊,其中標本館代碼依 Holmgren et al.1990. Index Herbariorum和傅立國等1993《中國植物標本館索引》(中國科技出版社)。縮寫代號HT: Holotype, IT: Isotype, T: Type。目前資料庫記錄數:30705條
6)植物名稱作者(命名人)資料庫
據統計,至今為止,中國植物命名作者多達五千餘人,其中命名兩個及兩個以上名稱的有近3500人。本資料庫就是基於這3500人的資料建立的,每條記錄包括作者全名及標準縮寫、工作/出生/生卒年代、專長類群等。中國作者(共919條目)還附有中文名及工作單位。本資料庫依據國內外多種書刊資料編輯而成,其中人名拼寫標準主要依據Brummitt & Powell 1992, Authors of Plant Names。類群代碼為:A:藻類;B:苔蘚;C:孢子植物;F:化石植物;M:真菌和地衣;P:蕨類;S:種子植物。目前資料庫記錄數:3481條。
7)中國植物分類學文獻要覽(1949-1990)
一般地,查詢20世紀50年代以前中國植物學文獻時可查詢E.D.Merrill & E.H.Walker 《東亞植物學文獻目錄》(1938)及其補編(1960),90年代以後資料的查詢則多利用各種網路資源。本資料庫填補了50年代至90年代之間的空白,它主要涵蓋中國大陸學者1949-1990年間發表的植物系統學文獻,內容包括作者姓名、論著題目及發表書刊等。本庫資料主要來源於《中國植物系統學文獻要覽》(陳心啟等1993,廣東科技出版社)。目前資料庫記錄數:6879條
8)標本採集地新舊地名對照資料庫
在我國,二十世紀初以前標本採集地的名稱,現今常有改變而不再使用。在這種情形下,很有必要通過對舊時和現在地圖的核對及參考相關採集資料,來製作新舊地名對照表,建立新舊地名資料庫,包括舊地名的經緯度數據,以供標本查詢及分類學研究之用。我們根據中國植物分類學家研究經驗,總結出包括11個省(市)2000多條採集地新舊地名對照記錄。每箇舊地名儘可能包括其舊外文名、位置(經緯度),並標明該地名在現今縣級行政區的名稱、國家標準代碼和經緯度。目前資料庫記錄數:2048條
9)中國植物標本館資料庫
本資料庫信息基本於《中國植物標本館索引》(傅立國等,1993)一書,共收錄全國300餘家標本館,並於最近對其中幾十家主要標本館信息進行了更新。每家標本館信息包括標本館名稱和地址、聯繫人及聯繫方法,館藏特色及收藏目標,以及主要研究人員信息等。
5.植物鑑定指南性資料
本部分資料庫包括互動式檢索表(又稱電子檢索表)和植物形態術語圖說等,目的是為用戶提供從植物特徵識別和標本鑑定,到上述的標本及圖像比對,一直到物種形態特徵描述和國內分布等一站式服務。
1)電子檢索表
這是一種互動的電腦程式,使用者不斷地向這個程式里輸入標本或活植物的性狀,那些不具有這些性狀的分類群將被排除掉,直到只剩下一個分類單元。它是系統植物學、生物編目與保護的一種非常好的鑑定工具。本檢索表提供檢索中國種子植物270餘個科的電子路徑。
2)科屬詞典資料庫
該庫轉接自成員單位網站,其信息來自侯寬昭主編、吳德鄰等人修訂的《中國種子植物科屬詞典》(第二版),共收集我國種子植物276科,3109屬,重點描述我國種子植物的科、屬形態、地理分布、屬種統計、主要經濟用途等。該書是我國植物學專業書籍銷量最大的圖書。其電子詞典製作的目的是為了方便用戶對植物多樣性學信息的獲取。
3)“植物鑑定和描述形態術語圖解”資料庫
包括種子植物形態術語1133條,涵蓋了植物鑑定和描述所使用的絕大部分術語,涉及根、莖、葉、花、花序、果實等植物器官。每個條目包括中、英文術語及其中英文釋義四部分內容。選詞標準規範,釋義準確、簡明扼要,大部分術語還配有一至多幅精美的線描圖(共1297幅),圖畫特徵明顯,對於讀者理解術語的含義大有裨益。本庫資料主要來源於Harris & Harris 1994, Plant Identification Terminology :An Illustrated Glossary (王宇飛等人譯,2001. 科學出版社)一書。
4)“國家重點保護野生植物名錄(第一、二批)”資料庫
第一批名錄已於一九九九年發布執行,第二批名錄經數年討論仍未正式發布,但已基本擬定,故一併列出,供用戶參考。兩個名錄總計約1900種(其中蘭科植物約占2/3)。該庫可查詢到植物名稱(中名、學名)、科名、批次及保護等級、國內分布(到省級)、海拔高度等信息。
6.科普及孢子植物欄目(分館)
1)苔蘚植物分館和蕨類植物分館
兩者均分列中國植物名錄、植物志、名詞解釋、植物照片、專家介紹及學科通訊等相關資料,利於專門用戶查訪。
2)科普分館
主要是基於植物物種多樣性開發的科學普及常識。其中 “標本館常規技術”和“常用藥用植物”兩個欄目是我們特地為“中國數字植物標本館”所編寫的。前者包括“標本採集和壓制”、“標本裝訂”、“用檢索表鑑定植物”和“植物名稱知識介紹”等標本館常用的專業技術;後者則選錄了全國範圍內常藥用植物百餘種加於介紹。每種內容包括名稱、來源、原植物形態特徵及功能主治等。每種植物還配有一幅精美的彩色圖畫。
此外“中國數字植物標本館”還辟有“網站建設介紹”、“信息反饋”和“相關網站”等欄目,其宗旨是為用戶提供全面而便捷的信息服務。

中國植物標本館索引

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標本館代碼
標本館名稱
建館時間
標本數量
主管部門
城市
PE
中國科學院植物研究所標本館
1928
2650000
中國科學院
北京
標本館簡介:標本館現收藏植物標本110.0萬份,是國內收藏植物類群較全(涵蓋除藻類以外的所有植物門類)的標本館,其中有種子植物標本90.0萬份(被子植物82.3萬、裸子植物0.7萬份和副號標本7.0萬份)、蕨類植物標本2.0萬份、苔蘚植物標本11.0萬份、大型真菌標本4.0萬份和地衣標本2.3萬份和木材標本0.6萬份。在這些館藏標本中,擁有各類模式標本約1.0萬份。改擴建後,還將規劃收藏浸泡標本以及果實、種子標本。本館收藏的植物標本來自全國,尤以西南及東喜馬拉雅地區的最為豐富。本館在中國乃至世界植物學研究、資源的開發利用及生物多樣性保護方面具有重要的地位,是中國植物學研究的重要基地。
歷史沿革:主要有1928 年成立的靜生生物調查所植物部和1929年成立的北平研究院植物研究所兩個單位於1950年合併成,合併時的標本約為200000份。
標本主要來源:中國高等植物
主要採集人:曹子余,章紹堯,張秀實,張永田,陳邦傑,陳少卿,陳偉烈,程樹志,鄭萬鈞,曲桂齡,陳煥鏞,戴天倫,方文培,馮國楣,G. Forest,傅國勛,傅坤俊,古漱義,貴州隊,郝景盛,賀賢育,河北隊,橫斷山考察,A. Henry,熊耀國,姜 恕,南水北調隊,江西隊,金佛山考察隊,九萬山考察隊,關克儉,孔憲武,郭本兆,賴書坤,郎楷永,李勃生,李國鳳,李啟和,李 馨,梁向日,荔波隊,E. Licent,林來官,林 榕,劉慎諤,劉繼孟,劉林翰,劉 瑛,隴西山考察隊,毛品一,黔北隊,倪志誠,聶敏祥,秦仁昌,青甘調查隊,青藏考察隊,邱炳雲,黔南隊,山西隊,四川經濟植物考察隊,四川藥用植物考察隊,四川植被考察隊,川黔隊,中美神農架隊,中德隊,雲南中蘇考察團,華東工作站,孫洪範,陶德定,蔡希陶,簡焯坡,鐘觀光,鐘補勤,崔友文,黃 志,王啟無,汪發瓚,王金亭,汪楣芝,王作賓,武素功,武陵山考察隊,夏緯英,新疆綜合考察隊,西藏隊。
主要著作:中國植物志 2,3(1),7,11,14,15,21,25(2),37,38,48(1),64(2),67(1),67(2),68,69,73(1),73(2),74,75,76(1),76(2),77(2),78(1));植物分類學報,中國高等植物圖鑑.
標本館館長:張憲春
通訊地址:100093 北京市香山南辛村20號

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