鬆弛型DNA(relaxed DNA)是2018年公布的生物物理學名詞。
基本介紹
- 中文名:鬆弛型DNA
- 外文名:relaxed DNA
- 所屬學科:生物物理學
- 公布時間:2018年

鬆弛型DNA(relaxed DNA)是2018年公布的生物物理學名詞。
鬆弛型DNA(relaxed DNA)是2018年公布的生物物理學名詞,指呈非超螺旋狀態的環狀雙鏈DNA分子。B型肝炎病毒(HBV)基因組在宿主細胞外以鬆弛環狀雙鏈DNA(rcDNA)形式存在,感染宿主後rcDNA轉化為...
鬆弛DNA 鬆弛DNA,呈非超螺旋狀態的環狀雙鏈DNA分子。如質粒或病毒DNA基因組,通常是超螺旋結構,在酶或者物理化學因子的作用下雙鏈核酸分子中一條單鏈出現斷裂並導致超螺旋結構破壞,形成帶切口的鬆弛DNA。
鬆弛控制型指質粒在細胞周期中可隨時進行複製,且每個細胞內拷貝數通常維持在20個以上的控制形式。其複製酶系獨立於染色體DNA複製系統,在染色體停止複製後仍能持續自主複製。典型代表為Col E1質粒及其衍生質粒,使用氯黴素阻斷染色體DNA合成時,拷貝數可增至1000-2000個,占細胞DNA總量的40%-50%。該類型質粒具有高拷貝...
鬆弛型質粒屬於細菌染色體外的遺傳因子,由閉合環狀雙鏈DNA構成,根據複製調控方式可分為鬆弛型與嚴緊型兩類。嚴緊型質粒複製與宿主染色體同步且拷貝數低(1-2個),而鬆弛型質粒在宿主染色體停止複製後仍能獨立增殖,每個細胞通常含有約20個拷貝。兩者的分類具有宿主特異性,例如同一質粒在大腸桿菌中可能表現為嚴緊型,...
鬆弛控制型質粒是一種遺傳學載體,其複製過程獨立於宿主細胞的分裂周期。這類質粒通過改造後的複製起點(ori)序列實現高頻複製,單個宿主細胞可容納幾十到幾百個拷貝。該調控機制源於質粒DNA特有的核苷酸排列方式,使其僅需宿主提供的少量複製蛋白即可啟動自主複製。複製機制與宿主關係 根據2020年遺傳工程研究數據,鬆弛...
DNA拓撲異構酶是一類催化DNA拓撲結構轉變的酶,通過切斷並重新連線DNA鏈實現超螺旋鬆弛或形成,分為Ⅰ型和Ⅱ型。Ⅰ型酶作用於單鏈且不依賴ATP,Ⅱ型酶切割雙鏈並需ATP供能。該酶家族存在於原核與真核生物中,包括大腸桿菌ω蛋白、DNA促旋酶及真核切斷-結合酶等。其功能涵蓋DNA複製、轉錄、重組及修復等過程,通過...
檢測與研究方法 超螺旋密度(σ)是衡量DNA扭曲程度的關鍵參數,計算公式為σ=(L-L₀)/L₀,其中L為實際連環數,L₀為鬆弛狀態理論值。瓊脂糖凝膠電泳可分辨不同超螺旋狀態的DNA分子,超螺旋程度越高遷移速率越快。螢光共振能量轉移(FRET)等生物物理技術可實時監測超螺旋動態變化過程。
[注意] 1、測序所用模板DNA的量一般按下面要求加入:模板種類/長度 模板量 200bp (PCR產物) 16ng(120fmol)3000-5000bp(超螺旋質粒DNA) 4mg (2pmol)48000bp(λ,粘粒DNA) 1mg(31fmol)由於超螺旋質粒產生的信號比鬆弛的線性雙鏈DNA弱,因此使用超螺旋質粒作為模板時其用量要比其它模板大一些。2、計算與4.5...
(1)測序所用模板DNA的量一般按下面要求加入:模板種類/長度 模板量 200 bp(PCR產物):16 ng(120 fmol)3000~5 000 bp(超螺旋質粒DNA): 4 mg(2 pmol)48 000 bp(λ,粘粒DNA): 1 mg(31 fmol)由於超螺旋質粒產生的信號比鬆弛的線性雙鏈DNA弱,因此使用超螺旋質粒作為模板時其用量要比其它...
H-DNA可在任何以鏡象重複的寡聚核苷酸中產生(核苷酸序列具有H迴文結構)。H-DNA的形成始於共聚物內部突環,其中的雙鏈在一邊輕微旋轉,摺疊回去,以生成第一個三股鹼基對。這種成核過程建立了一種非平衡的H-DNA構型。纏繞與變性導致了其餘DNA分子負超螺旋鬆弛。3′和5′一半的多聚嘧啶鏈都可以作H-DNA的給予體...
DNA鏈的鬆弛和解旋是真核基因起始mRNA合成的先決條件。轉錄後水平的調控 真核生物基因轉錄在細胞核內進行,而翻譯則在細胞質中進行。在轉錄過程中真核基因有插入序列,結構基因被分割成不同的片段,因此轉錄後的基因調控是真核生物基因表達調控的一個重要方面,首要的是RNA的加工、成熟。各種基因轉錄產物RNA,無論rRNA、tRNA
Ⅱ型DNA拓撲異構酶 Ⅱ型DNA拓撲異構酶是2008年公布的生物化學與分子生物學名詞。定義 編號:EC5.99.1.3。使雙鏈結構的兩條鏈均暫時斷裂,斷裂時依賴於ATP,是將鬆弛、閉環DNA轉變為超螺旋形式的酶。包括DNA促旋酶。出處 《生物化學與分子生物學名詞》
細胞外B型肝炎病毒DNA是一種鬆弛環狀的雙鏈DNA(relaxed circularDNA,rcDNA)分子。cccDNA是B肝病毒前基因組RNA複製的原始模板,雖然其含量較少,每個肝細胞內只有約5~50個拷貝,但對B肝病毒的複製以及感染狀態的建立具有十分重要的意義,只有清除了細胞核內的cccDNA,才能徹底消除B肝患者病毒攜帶狀態,是抗病毒治療...
自主質粒是存在於真核細胞核外或原核生物擬核區外的遺傳單位,能夠獨立進行複製,主要包括細菌的環狀DNA分子及真核細胞器(如線粒體、葉綠體)中的DNA等類型。根據複製特性可分為嚴緊型與鬆弛型:嚴緊型質粒複製與宿主染色體同步,每個細胞僅有1-2個拷貝;鬆弛型質粒可在宿主染色體停止複製後繼續增殖,拷貝數可達數千...
質粒拷貝數指單個細菌細胞中質粒DNA分子的數量,是基因工程和微生物遺傳研究的關鍵參數。根據質粒複製特性可分為嚴緊型(1-2個拷貝)與鬆弛型(20個左右拷貝,藥物抑制下可達數千)。不同拷貝數質粒在克隆穩定性、基因表達調控等方面具有差異化套用價值。2021年研究發現IncI2質粒通過PcnR蛋白精確調控拷貝數以平衡耐藥...
在細胞中有兩種狀態,一是“緊密型”;二是“鬆弛型”。此外還應具有分子量小,易轉化,有一至多個選擇標記的特點。質粒型載體一般只能攜帶10kb以下的DNA片段,適用於構建原核生物基因文庫,cDNA庫和次級克隆。②噬菌體DNA:常用的λ噬菌體的DNA是雙鏈,長約49kb,約含50個基因,其中50%的基因對噬菌體的生長和...
在鬆弛環狀DNA中,Wr近似為零,Tw值等於自然狀態下的螺旋圈數 引入負超螺旋會導致Tw減少,同時Wr絕對值增大以適應總連環數恆定 正超螺旋則引起Tw增加 三種典型DNA構型的Tw值差異顯著:B-DNA:每圈螺旋含10.5個鹼基對,Tw值由總鹼基對數除以10.5確定 A-DNA:螺旋周期縮短至11個鹼基對,導致Tw值相應增加 Z-...
在提取質粒過程中,除了超螺旋DNA外,還會產生其它形式的質粒DNA。如果質粒DNA兩條鏈中有一條鏈發生一處或多處斷裂,分子就能旋轉而消除鏈的張力,形成鬆弛型的環狀分子,稱開環DNA(Open circularDNA,簡稱ocDNA);如果質粒DNA的兩條鏈在同一處斷裂,則形成線狀DNA(LinearDNA)。當提取的質粒DNA電泳時,同一質粒DNA...
酵母整合型質粒是不能再染色體外能夠進行自主複製的遺傳單位,必須整合到酵母染色體上才能進行複製。基本概念 酵母整合型質粒 分類:遺傳學 質粒是染色體外能夠進行自主複製的遺傳單位,包括真核生物的細胞器和細菌細胞中染色體以外的脫氧核糖核酸(DNA)分子。習慣上用來專指細菌、酵母菌和放線菌等生物中染色體以外的DNA...
質粒:原核、細菌、小環DNA。鬆弛型和嚴緊型2類。線粒體基因:mtDNA,線狀、環狀,能單獨複製,同時受核基因控制。哺乳動物:無內含子,有重疊基因突變率高。葉綠體基因:cpDNA,環狀,可自主複製,也受核基因控制。卡巴粒:草履蟲體內細胞質顆粒 細胞質遺傳:子代的性狀是由細胞質內的基因所控制的遺傳現象。也叫...
將互補的單鏈環狀DNA轉變成具有螺旋結構的雙鏈環狀DNA,使單鏈DNA打結(topological knot)或解結。另外在二個環狀雙鏈DNA一個分子的一個鏈切斷時,形成鏈環狀二聚體的分子(ca-tenane)。在Ⅱ型拓撲異構酶中,DNA促旋酶可單獨催化閉環狀DNA產生超螺旋,這是獨特的。其它二個型的酶,除可使超螺旋鬆弛也需要ATP...
卵裂是動物受精卵通過快速有絲分裂將卵質分割為多個小細胞的過程,形成中空囊胚。其特點表現為細胞周期短、缺少G1期,卵裂球體積逐漸減小且核質比增大至平衡狀態。分裂模式受卵黃含量與分布影響,分為完全卵裂(如輻射型)和不完全卵裂(如盤狀、表面型)。卵裂由微絲收縮環驅動,可被細胞鬆弛素B抑制。分裂期伴隨DN...
Plasmid(質粒)是遺傳學術語,指細菌細胞中獨立於染色體存在的環狀DNA分子,具有自主複製能力,可在不同細菌間轉移基因信息。該詞在中文中譯為“質粒”或“質體”,英式與美式發音均為[ˈplæzmɪd],屬於生物學領域專有名詞。質粒通常攜帶抗生素抗性基因或代謝功能基因,幫助細菌適應環境變化。其環狀結構特性使...
接合性質粒是攜帶轉移相關基因的環狀DNA分子,通過性菌介導的細胞直接接觸實現細菌間傳遞。其核心結構包含轉移起始位點(oriT)、鬆弛酶和分泌系統等模組,分為自轉移型(如F因子、RP4)與可轉移型兩類。F質粒作為典型窄宿主質粒,通過TraI酶啟動DNA單鏈轉移;RP4質粒則具有跨革蘭氏陰陽性菌的寬宿主特性,其衍生輔助...
胰腺細胞內DNA含量一般在死後6小時尚無明顯改變,至36~48小時後基本消失。間質小血管腔內大部分紅細胞溶解,僅見紅細胞輪廓。發展到瀰漫性自溶時,胰腺細胞境界不清,胞漿染成污紫紅色,核溶解、消失。進一步發展後,胰腺的組織結構不能辨認。由於胰腺可發生局灶性和多中心性自溶,在部分猝死、急性中毒或機械性窒息...
DNA疫苗:通常用 BoNT重組DNA免疫動物後表達蛋白,進而刺激免疫系統產生抗體或T細胞介導的免疫應答。套用 去皺紋 1) 技術原理 口輪匝肌與皮膚緊密連線,收縮時直接牽動皮膚,和動力性皺紋的形成有關。而肉毒毒素是一種生物毒素類肌肉鬆弛劑,它通過抑制乙醯膽鹼的釋放,阻斷神經肌肉傳導,導致肌肉鬆弛性麻痹,從而抑制...
接合過程中通過滾環複製機制轉移單鏈DNA,使受體菌獲得供體菌遺傳性狀。性質粒不僅決定細菌性別分化,還在耐藥性傳播和環境污染治理中發揮重要作用。分子結構特徵 轉移操縱子:tra基因簇編碼性菌毛合成、DNA轉移相關蛋白,包括IV型分泌系統(T4SS)組件 oriT位點:轉移起始位點由TraI鬆弛酶特異性識別並切割,啟動單鏈DNA...
單個鹼基的取代是突變的主要形式,最常發生的是COL1A1或COL1A2上甘氨酸的密碼子被其他胺基酸的密碼子所取代,而甘氨酸是三股螺旋中每條α鏈上的最本質的胺基酸。當其被取代時,就會導致疾病的發生。除取代單個鹼基外,其他突變還包括插入、缺失、DNA剪接缺陷及COL1A1無效等位基因的出現。每個成骨不全的家族有自己...
缺乏睡眠對細胞氧化更新的後果,其主要導致組織的損壞,這一過程是通過酶的作用來修復的,對於分子間的不斷修復和細胞的總體最高壽命是分不開的,就衰老而言,最重要的檢出DNA的損傷並修復他們,而細胞的完整性又是其分裂增殖壽命的基礎,而這種修復機制是在生命體進行高深度睡眠下完成的。有科研實驗表明,高強度的...
