陳義華，男，博士，中國科學院微生物研究所研究員、百人計畫。微生物天然產物及其生物合成研究組組長。主要從事微生物天然產物資源的開發和生物合成機理的研究。2005年畢業於中國科學院微生物研究所，獲理學博士學位。2006-2011年在美國威斯康星大學麥迪遜分校（UW-Madison）做博士後，進行微生物次級代謝產物生物合成方面的研究。2011年通過中國科學院“百人計畫”引進到微生物研究所微生物資源前期開發國家重點實驗室開始獨立的科研工作。研究興趣集中在微生物次級代謝產物的生物合成及功能上。在國際主流刊物PNAS、JBC等發表論文16篇。
基本介紹
- 中文名：陳義華
- 國籍：中國
- 職業：中國科學院微生物所研究員
- 畢業院校：南京農業大學
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基本信息
陳義華學習經歷
1994年9月-1998年6月 南京農業大學，大學本科
1998年9月-2001年6月 南京農業大學，碩士研究生
2001年9月-2005年7月 中國科學院微生物研究所，博士研究生
工作經歷
2006年7月-2011年4月 美國威斯康星大學—麥迪遜分校 (UW-Madison)， 博士後、研究助理 （Postdoc Research Associate）
2011年4月- 中國科學院微生物研究所，研究員
研究方向
主要從事微生物天然產物資源的開發和生物合成機理的研究。
微生物次級代謝的研究。以放線菌為主要研究對象，致力於運用分子遺傳學、生物化學、化學和生物信息學的綜合手段來研究微生物來源的活性次級代謝產物。解析它們的合成機理和生物學功能，尋找新的代謝機理和具有良好生物活性的新化合物。希望在對這些具有實用價值的活性分子的生物合成充分了解的基礎上，設計合理的工程策略，改造目標分子。同時嘗試利用基因組發掘（Genome mining）的方法得到新的微生物次級產物。
研究內容及意義
微生物天然產物是藥用小分子、食品添加劑等的重要來源之一。關於微生物天然產物的研究對現代人生活和健康狀況的改善起了極大的推動作用。本實驗室致力於運用分子遺傳學、生物化學、化學和生物信息學的綜合手段來研究微生物生產的具有實用價值的生物活性分子。主要包括以下兩個方面的研究內容：
（1） 選擇有實用價值的微生物來源的活性分子，利用不同的手段研究其生物合成機理。在對微生物來源活性分子的生物合成機理充分了解的基礎上，設計合理的工程策略，改造目標分子。
（2） 微生物的全基因組測序揭示，遠遠超過已知化合物數量的天然產物合成基因簇存在於微生物基因組中。希望利用新發展的基因組學手段，探索微生物生產天然產物的潛力，並選擇特定的菌種或特殊類型的化合物，嘗試利用基因組發掘的方法得到新的活性分子。
代表論著
·Yihua Chen, Min Yin, Geoff P. Horsman, and Ben Shen. (2011) Improvement of the Enediyne Antitumor Antibiotic C-1027 Production by Manipulating Its Biosynthetic Pathway Regulation in Streptomyces globisporus. Journal of Natural Products 74: 420-424.
·Yihua Chen, Evelyn Wendt-Pienkowski, Jianhua Ju, Shuangjun Lin, Scott R. Rajski, and Ben Shen. (2010) Characterization of FdmV as an amide synthetase for fredericamycin A biosynthesis in Streptomyces griseus ATCC 43944. The Journal of Biological Chemistry 285: 38853-38860.
·Geoff P. Horsman*, Yihua Chen*, Jon S. Thorson, and Ben Shen. (2010) Polyketide synthase chemistry does not direct biosynthetic divergence between 9- and 10-membered enediynes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107: 11331-11335 (*co-first author)
·Yihua Chen, Min Yin, Geoff P. Horsman, Shengxiong Huang, and Ben Shen. (2010) Manipulation of pathway regulation in Streptomyces globisporus for overproduction of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. The Journal of Antibiotics 63: 482-485.
·Yihua Chen*, Keqiang Fan*, Yongzhi He, Xinping Xu, Yanfeng Peng, Tingting Yu, Cuijuan Jia and Keqian Yang. (2010) Characterization of JadH as an FAD- and NAD(P)H-dependent bifunctional hydroxylase/dehydrase involved in jadomycin biosynthesis. ChemBioChem. 11: 1055-1060. (*co-first author)
·Yihua Chen, Micheal J Smanski, and Ben Shen. (2010) Improvement of secondary metabolite production in Streptomyces by manipulating pathway regulation. Applied Microbiology and Biotechnology 86: 19-25.
·Yihua Chen, Evelyn Wendt-Pienkoski, Scott R. Rajski, and Ben Shen (2009) In vivo investigation of the roles of FdmM and FdmM1 in fredericamycin biosynthesis unveiling a new family of oxygenases. The Journal of Biological Chemistry 284: 24735-24743.
·Yihua Chen, Evelyn Wendt-Pienkowski, and Ben Shen (2008) Identification and utility of FdmR1 as a Streptomyces antibiotic regulatory protein activator for fredericamycin production in Streptomyces griseus ATCC 49344 and heterologous hosts. Journal of Bacteriology 190: 5587-5596.
·Yihua Chen, Yinggang Luo, Jianhua Ju, Evelyn Wendt-Pienkowski, Scott R. Rajski, and Ben Shen. (2008) Identification of fredericamycin E from Streptomyces griseus: insights into fredericamycin A biosynthesis highlighting carbaspirocycle formation. Journal of Natural Products 71: 431-437.
·Yi-hua Chen, Chen-chen Wang, Lisa Greenwell, Uwe Rix, Dirk Hoffmeister, Leo C. Vining, Jürgen Rohr, and Ke-qian Yang (2005) Functional analyses of oxygenases in jadomycin biosynthesis and identification of JadH as a bifunctional oxygenase/dehydrase. The Journal of Biological Chemistry 280: 22508-22514.
·Xiang-Jing Wang, Yi-Jun Yan, Bo Zhang, Jing An, Ji-Jia Wang, Jun Tian, Ling Jiang, Yi-Hua Chen, et al. and Wen-Sheng Xiang (2010) Genome Sequence of the Milbemycins-producing Bacterium Streptomyces bingchenggensis. Journal of Bacteriology 192: 4526-4527.
·Shuangjun Lin, Geoffrey P. Horsman, Yihua Chen, Wenli Li, and Ben Shen (2009) Characterization of the SgcF epoxide hydrolase supporting a (R)-vicinal diol intermediate for enediyne antitumor antibiotic C-1027 biosynthesis. Journal of American Chemical Society 131: 16410-16417.
·Si-Kyu Lim, Jianhua Ju, Emmanuel Zazopoulos, Hui Jiang, Jeong-Woo Seo, Yihua Chen, Zhiyang Feng, Scott R. Rajski, Chris M. Farnet, and Ben Shen (2009) Iso-migrastatin, migrastatin, and dorrigocin production in Streptomyces platensis NRRL 18993 is governed by a single biosynthetic machinery featuring an acyltransferase-less type I polyketide synthase. The Journal of Biological Chemistry 284:29746-29756.
·Uwe Rix, Chenchen Wang, Yihua Chen, Fredilyn M. Lipata, Lily L. Remsing Rix, Lisa M. Greenwell, Leo C. Vining, Keqian Yang, and Jürgen Rohr (2005) The oxidative ring cleavage in jadomycin biosynthesis: a multistep oxygenation cascade in a biosynthetic black box. ChemBioChem 6: 1-8.
