自裝配系統是蛋白質或脂類基於其分子識別特性而自集合成的一種穩定的、可控制的固定功能分子的結構。 可用於設計和製作功能表而、膜或微管.例如，由細菌分泌出的親水性多膚，能自裝配成具有納米級孔隙的脂類膜或脂質體包囊，可用於膜分離系統、感測器和利用抗原、抗體偶合導向作為藥物傳遞載體。
